256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1953 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
367 aa  752    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  33.51 
 
 
354 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  32.31 
 
 
363 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  29.78 
 
 
357 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  29.49 
 
 
348 aa  153  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  32.31 
 
 
336 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  30.6 
 
 
347 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  29.33 
 
 
358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 
343 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  30.51 
 
 
349 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  29.56 
 
 
361 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  27.96 
 
 
331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  28.33 
 
 
364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  28.65 
 
 
333 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  30.45 
 
 
341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  27 
 
 
345 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  27.02 
 
 
345 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  31.41 
 
 
352 aa  125  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  27.42 
 
 
347 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  29.69 
 
 
349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  33.2 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  27.04 
 
 
335 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  26.67 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  28.97 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  26.67 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  26.67 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  28.88 
 
 
343 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 
444 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  30.88 
 
 
377 aa  99.4  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  28.62 
 
 
383 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  28.26 
 
 
383 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  30.53 
 
 
374 aa  97.8  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  25.68 
 
 
383 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  27.25 
 
 
378 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  26.22 
 
 
395 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  26.98 
 
 
378 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  24.26 
 
 
378 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  26.71 
 
 
398 aa  87.8  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  26.68 
 
 
373 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  27.58 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  25.82 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  24.88 
 
 
268 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  23.48 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3510  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  25.96 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  24.71 
 
 
424 aa  69.7  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  26.94 
 
 
489 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  26.13 
 
 
489 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  25.91 
 
 
489 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  27.49 
 
 
392 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  26.97 
 
 
493 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  23.96 
 
 
383 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  30.77 
 
 
500 aa  63.5  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  22.81 
 
 
264 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  22.47 
 
 
278 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  24.64 
 
 
548 aa  62.4  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  27.53 
 
 
395 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  25.15 
 
 
284 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  25.98 
 
 
479 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  26.77 
 
 
362 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  25.7 
 
 
503 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  27.27 
 
 
490 aa  60.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  27.43 
 
 
480 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  25.7 
 
 
445 aa  59.7  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  27.72 
 
 
478 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4033  peptidase M48, Ste24p  26.87 
 
 
521 aa  59.7  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  26.87 
 
 
521 aa  59.7  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  25.71 
 
 
513 aa  59.3  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  23.57 
 
 
553 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  26.03 
 
 
541 aa  59.3  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  23.93 
 
 
573 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  29.11 
 
 
447 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  25.77 
 
 
474 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  26.83 
 
 
365 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  24.71 
 
 
268 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  27.09 
 
 
479 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  23.11 
 
 
604 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  27.78 
 
 
554 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  27.09 
 
 
479 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  24.21 
 
 
640 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  25.91 
 
 
492 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  21.84 
 
 
292 aa  56.6  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  23.75 
 
 
271 aa  56.2  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  28.07 
 
 
265 aa  55.8  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  26.47 
 
 
504 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  26.63 
 
 
505 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  25 
 
 
479 aa  55.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  22.08 
 
 
292 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  26.99 
 
 
562 aa  54.3  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  26.88 
 
 
262 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  24.26 
 
 
561 aa  53.9  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45606  predicted protein  27.42 
 
 
366 aa  53.5  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0166385  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  26.37 
 
 
496 aa  53.1  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  27.27 
 
 
275 aa  53.1  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  26.23 
 
 
275 aa  53.1  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  30.06 
 
 
486 aa  53.1  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  25.31 
 
 
549 aa  53.1  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  21.97 
 
 
284 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  22.75 
 
 
474 aa  52.8  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  25.77 
 
 
497 aa  52.8  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  25.91 
 
 
262 aa  52.8  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>