More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5225 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 358 aa  745    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  37.2 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  35.5 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  36.59 
 
 		 268 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  35.88 
 
 		 484 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  29.8 
 
 		 500 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  33.18 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  26.36 
 
 		 364 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  34.52 
 
 		 489 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  35.75 
 
 		 573 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  31.78 
 
 		 553 aa  103  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  35.06 
 
 		 480 aa  103  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  29 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  35.19 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  31.11 
 
 		 486 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  36.16 
 
 		 492 aa  99.8  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  34.44 
 
 		 605 aa  99.8  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  36.16 
 
 		 469 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  36 
 
 		 474 aa  98.2  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  28.81 
 
 		 565 aa  97.1  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  24.44 
 
 		 359 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  34.87 
 
 		 561 aa  95.9  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  28.11 
 
 		 480 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  27.68 
 
 		 383 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  29 
 
 		 424 aa  94.7  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  26.37 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  29.74 
 
 		 395 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  34.38 
 
 		 479 aa  94.4  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  27.6 
 
 		 475 aa  94  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  27.24 
 
 		 562 aa  93.6  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  30.27 
 
 		 503 aa  93.2  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  26.57 
 
 		 347 aa  92.8  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  33.88 
 
 		 569 aa  93.2  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 		 529 aa  92.8  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  33.88 
 
 		 567 aa  92.8  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  24.36 
 
 		 357 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 489 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  27.19 
 
 		 474 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  32.18 
 
 		 493 aa  90.9  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  31.25 
 
 		 514 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  28.74 
 
 		 280 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  27.03 
 
 		 373 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  28.63 
 
 		 487 aa  90.5  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  30.1 
 
 		 489 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  27.8 
 
 		 269 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  27.39 
 
 		 269 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 		 483 aa  89.7  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  35.4 
 
 		 483 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  27.69 
 
 		 502 aa  89.7  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  33.68 
 
 		 490 aa  89.7  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  31.95 
 
 		 445 aa  89.7  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  27.39 
 
 		 269 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  27.39 
 
 		 269 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  27.72 
 
 		 268 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  30.89 
 
 		 489 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  25.28 
 
 		 378 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  27.44 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  28.1 
 
 		 331 aa  88.6  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  31.01 
 
 		 528 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  29.61 
 
 		 479 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  33.74 
 
 		 478 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  34.84 
 
 		 640 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  35.21 
 
 		 604 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  30.51 
 
 		 490 aa  87.4  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 479 aa  87.4  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 278 aa  87.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  29.28 
 
 		 481 aa  87  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  32.73 
 
 		 533 aa  87  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  35.62 
 
 		 262 aa  87  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  26.38 
 
 		 284 aa  87  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  27.97 
 
 		 473 aa  86.7  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  29.56 
 
 		 284 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  29.13 
 
 		 493 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  29.68 
 
 		 289 aa  86.3  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  27.27 
 
 		 479 aa  85.9  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01850  mitochondrial inner membrane metallopeptidase Oma1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09730)  35.46 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  30.63 
 
 		 280 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0829  peptidase M48 Ste24p  28.81 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  27.78 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  27.71 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  31.11 
 
 		 562 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  31.18 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  29.7 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  27.44 
 
 		 489 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  29.75 
 
 		 632 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  30 
 
 		 549 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  28.71 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  30.41 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  31.52 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  29.75 
 
 		 632 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  32.62 
 
 		 566 aa  84.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  30.94 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  31.46 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  26.88 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  24.22 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0679  peptidase M48 Ste24p  28.69 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  32.84 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1396  peptidase M48 Ste24p  28.48 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  30.68 
 
 		 589 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>