More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0492 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
553 aa  1073    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  49.12 
 
 
533 aa  420  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  46.73 
 
 
549 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  43.68 
 
 
548 aa  385  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  44 
 
 
541 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4033  peptidase M48, Ste24p  45.11 
 
 
521 aa  363  4e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  44.91 
 
 
521 aa  359  6e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  44.08 
 
 
514 aa  356  5.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  40.18 
 
 
554 aa  351  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  41.25 
 
 
521 aa  341  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0392  peptidase M48, Ste24p  44.83 
 
 
525 aa  306  9.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  37.52 
 
 
561 aa  242  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  33.4 
 
 
562 aa  238  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  36.36 
 
 
567 aa  236  7e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  33.08 
 
 
605 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  36.05 
 
 
569 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  31.66 
 
 
565 aa  233  9e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  35.93 
 
 
564 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  35.93 
 
 
564 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  34.5 
 
 
573 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  36.63 
 
 
564 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  36.08 
 
 
588 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  36.08 
 
 
588 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  35.4 
 
 
593 aa  211  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  34.4 
 
 
590 aa  207  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  35.06 
 
 
588 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  46.5 
 
 
589 aa  204  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  46.5 
 
 
589 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  46.5 
 
 
572 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  46.5 
 
 
572 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  46.5 
 
 
572 aa  203  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  46.5 
 
 
572 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  46.5 
 
 
560 aa  203  8e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  46.09 
 
 
589 aa  201  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  46.72 
 
 
569 aa  197  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  31.28 
 
 
502 aa  196  7e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  43.06 
 
 
562 aa  193  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
479 aa  192  9e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  42.02 
 
 
483 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  30.04 
 
 
484 aa  176  8e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  34.67 
 
 
500 aa  176  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  43.04 
 
 
518 aa  169  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  37.13 
 
 
487 aa  168  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  36.21 
 
 
480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  38.61 
 
 
484 aa  163  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  36.19 
 
 
475 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  28.9 
 
 
484 aa  161  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  36.71 
 
 
484 aa  161  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  29.28 
 
 
483 aa  161  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  35.68 
 
 
474 aa  160  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  40.56 
 
 
486 aa  156  9e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  35.32 
 
 
485 aa  153  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  27.1 
 
 
483 aa  152  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  27.57 
 
 
490 aa  148  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
486 aa  148  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  29.35 
 
 
478 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  31.71 
 
 
487 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  31.71 
 
 
487 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  31.71 
 
 
487 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  36.86 
 
 
554 aa  145  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  29.1 
 
 
477 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
486 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  31.26 
 
 
487 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  29.35 
 
 
478 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  31.26 
 
 
487 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  27.92 
 
 
503 aa  144  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  30.32 
 
 
477 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  29.35 
 
 
478 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  29.16 
 
 
478 aa  143  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  35.98 
 
 
488 aa  143  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  37.08 
 
 
473 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2164  protease  36.5 
 
 
568 aa  143  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  34.57 
 
 
566 aa  143  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  35.71 
 
 
489 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  30.19 
 
 
477 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410651 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  32.46 
 
 
487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  32.46 
 
 
487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  32.46 
 
 
487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
494 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  32.46 
 
 
487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  32.46 
 
 
487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  32.46 
 
 
487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  34.87 
 
 
488 aa  141  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  26.55 
 
 
489 aa  141  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  32.46 
 
 
487 aa  141  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  32.09 
 
 
487 aa  140  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  32.97 
 
 
489 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  32.97 
 
 
489 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  32.97 
 
 
489 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  32.97 
 
 
489 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  34.89 
 
 
489 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  28.29 
 
 
477 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  32.09 
 
 
487 aa  139  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  33.46 
 
 
487 aa  139  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  36.54 
 
 
481 aa  139  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  28.36 
 
 
487 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  34.9 
 
 
486 aa  139  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  34.3 
 
 
485 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  33.74 
 
 
489 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  33.72 
 
 
487 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>