More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0581 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 361 aa  726    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  93.96 
 
 		 364 aa  670    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  78.55 
 
 		 358 aa  550  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  56.2 
 
 		 341 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  55.14 
 
 		 347 aa  348  8e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  39.26 
 
 		 347 aa  196  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  37.71 
 
 		 357 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  35.2 
 
 		 354 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  33.7 
 
 		 363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  36.81 
 
 		 348 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  34.94 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  36.72 
 
 		 327 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  34.27 
 
 		 398 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  35.73 
 
 		 383 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 349 aa  159  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  35.16 
 
 		 383 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  34.58 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  35.96 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  33.8 
 
 		 349 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  34.5 
 
 		 374 aa  149  9e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  35.17 
 
 		 383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  35.04 
 
 		 377 aa  146  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  30.29 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  29.33 
 
 		 367 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  35.06 
 
 		 352 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  38.6 
 
 		 444 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  30.86 
 
 		 333 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  33.24 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  37.13 
 
 		 331 aa  133  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  29.94 
 
 		 345 aa  123  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  30.25 
 
 		 348 aa  122  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  30.25 
 
 		 348 aa  122  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  30.25 
 
 		 348 aa  122  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  30.31 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  34.08 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  33.43 
 
 		 378 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  33.15 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  31.53 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  29.49 
 
 		 359 aa  96.3  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  28.81 
 
 		 383 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  27.39 
 
 		 358 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  28.57 
 
 		 264 aa  89.7  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  29.34 
 
 		 395 aa  87  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  27.49 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3510  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  25.48 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  34.62 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  26.26 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  33.14 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  32.37 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  34.25 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  26.13 
 
 		 279 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  28.93 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  32.95 
 
 		 513 aa  71.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  26.67 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  31.9 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  29.38 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  34.73 
 
 		 493 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  29.38 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  29.52 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  29.78 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  32.16 
 
 		 490 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  24.44 
 
 		 632 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  25.24 
 
 		 632 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  30.67 
 
 		 604 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  33.53 
 
 		 479 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  32.56 
 
 		 514 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  28.42 
 
 		 479 aa  69.7  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  32.94 
 
 		 479 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  32.95 
 
 		 549 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  35.63 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  32.34 
 
 		 541 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  31.28 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0608  peptidase M48, Ste24p  26.86 
 
 		 297 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.485097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  31.35 
 
 		 504 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  32.77 
 
 		 553 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  30.46 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  34.48 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  30.85 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  34.48 
 
 		 475 aa  67  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  25.31 
 
 		 320 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  28.3 
 
 		 453 aa  67  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  27.54 
 
 		 492 aa  66.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  30.45 
 
 		 479 aa  66.2  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  29.47 
 
 		 565 aa  66.2  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  33.74 
 
 		 548 aa  66.2  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  28.74 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  32.91 
 
 		 528 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  28.72 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  30 
 
 		 554 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  30.3 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  32.34 
 
 		 521 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  26.77 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  32.57 
 
 		 589 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 605 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4033  peptidase M48, Ste24p  32.34 
 
 		 521 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  30.3 
 
 		 503 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  31.11 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  30.54 
 
 		 487 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.433705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>