More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3534 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
383 aa  742    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  89.56 
 
 
383 aa  621  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  88.51 
 
 
383 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  82.44 
 
 
395 aa  514  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  36.04 
 
 
341 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  35.16 
 
 
364 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  37.54 
 
 
361 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  36.13 
 
 
358 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  35.19 
 
 
347 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  33.14 
 
 
354 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  34.26 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  34.6 
 
 
347 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  33.71 
 
 
363 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  36.67 
 
 
336 aa  139  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  33.43 
 
 
349 aa  138  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  31.63 
 
 
345 aa  134  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  33.14 
 
 
357 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  33.53 
 
 
343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  35.29 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  34.5 
 
 
374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  37.09 
 
 
377 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  31.72 
 
 
348 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  31.72 
 
 
348 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  31.72 
 
 
348 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  31.82 
 
 
348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  30.97 
 
 
333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  30.03 
 
 
345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  32.75 
 
 
349 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  33.02 
 
 
398 aa  123  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  35.67 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  34.43 
 
 
444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  25.68 
 
 
367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  27.66 
 
 
335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  29.97 
 
 
353 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  35.02 
 
 
365 aa  99.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  33.06 
 
 
359 aa  93.2  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  30.41 
 
 
378 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  30.67 
 
 
424 aa  89.4  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  35.21 
 
 
561 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  34.01 
 
 
567 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  30.67 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
378 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  28.07 
 
 
268 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  34.01 
 
 
569 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  35.37 
 
 
383 aa  87  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  27.63 
 
 
268 aa  87  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  30.07 
 
 
378 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  31.11 
 
 
278 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  31.11 
 
 
553 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  39.62 
 
 
494 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  27.3 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  30.53 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  36.84 
 
 
470 aa  82  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  32.35 
 
 
474 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  30.72 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  37.59 
 
 
489 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  35.86 
 
 
489 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  38.27 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  37.82 
 
 
483 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  36.43 
 
 
489 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  37.65 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  33.33 
 
 
589 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  32.76 
 
 
483 aa  77.8  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  33.91 
 
 
572 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  33.54 
 
 
490 aa  77.4  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  33.91 
 
 
589 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  33.91 
 
 
572 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  33.91 
 
 
560 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  33.91 
 
 
589 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  33.91 
 
 
572 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  33.15 
 
 
593 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  33.91 
 
 
572 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  30.67 
 
 
445 aa  77  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  34.25 
 
 
640 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  32.35 
 
 
605 aa  77  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  29.76 
 
 
480 aa  76.6  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  27.9 
 
 
395 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  35.98 
 
 
565 aa  76.3  0.0000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  23.85 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  33.11 
 
 
493 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  33.7 
 
 
588 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  34.48 
 
 
564 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  30.54 
 
 
489 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  33.89 
 
 
562 aa  74.7  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  37.04 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  33.54 
 
 
573 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  32.91 
 
 
479 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  33.91 
 
 
564 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  33.53 
 
 
475 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  33.91 
 
 
564 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  33.91 
 
 
588 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  35.29 
 
 
481 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  33.91 
 
 
588 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  22.5 
 
 
632 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  32 
 
 
447 aa  74.3  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
492 aa  73.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  22.5 
 
 
632 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0679  peptidase M48 Ste24p  30.43 
 
 
472 aa  73.9  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  26.7 
 
 
479 aa  73.6  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  29.86 
 
 
604 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>