More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0007 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0007  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  556  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0007  peptidase M48 Ste24p  99.26 
 
 
271 aa  551  1e-156  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  69.29 
 
 
268 aa  392  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0006  peptidase M48 Ste24p  66.29 
 
 
268 aa  340  1e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889597 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  44.66 
 
 
293 aa  215  7e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  44.49 
 
 
269 aa  208  6e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  46.03 
 
 
263 aa  208  6e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  45.02 
 
 
263 aa  207  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  44.72 
 
 
268 aa  206  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  41.35 
 
 
262 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  40.93 
 
 
266 aa  203  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  42.97 
 
 
262 aa  201  9e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  41.96 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  42.86 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  42.86 
 
 
269 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  44.27 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  42.48 
 
 
269 aa  199  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  42.59 
 
 
268 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  42.41 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  45.22 
 
 
266 aa  194  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  41.95 
 
 
266 aa  191  8e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  43.86 
 
 
231 aa  191  9e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  41.51 
 
 
269 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  41.13 
 
 
269 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  41.13 
 
 
269 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  41.96 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  39.86 
 
 
268 aa  188  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  42.04 
 
 
266 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  40.86 
 
 
272 aa  185  7e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  42.21 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  35.66 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2450  peptidase M48, Ste24p  41.74 
 
 
264 aa  156  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.195879  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  40.39 
 
 
262 aa  155  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  41.59 
 
 
270 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  40.71 
 
 
247 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  38.63 
 
 
284 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  36.84 
 
 
248 aa  143  3e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0018  peptidase M48, Ste24p  33.84 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  35.63 
 
 
275 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  34.96 
 
 
258 aa  136  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  39.09 
 
 
259 aa  133  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  32.93 
 
 
267 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  31.65 
 
 
270 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  31.41 
 
 
270 aa  132  7.999999999999999e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1406  peptidase M48 Ste24p  34.25 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  33.19 
 
 
270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  33.78 
 
 
280 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  35.02 
 
 
271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  34.57 
 
 
278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  32.25 
 
 
267 aa  125  6e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
268 aa  125  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  33.59 
 
 
265 aa  123  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12433  hypothetical protein  40.48 
 
 
274 aa  123  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0709327  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
271 aa  122  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  33.83 
 
 
274 aa  122  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  33.73 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  32.81 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  31.37 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  31.62 
 
 
272 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01850  mitochondrial inner membrane metallopeptidase Oma1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09730)  37.28 
 
 
376 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2760  peptidase M48 Ste24p  35.74 
 
 
298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.293753  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41270  Peptidase M48, Ste24p family  33.21 
 
 
273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1890  Zn-dependent protease  33.33 
 
 
273 aa  118  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  35.25 
 
 
265 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  36.32 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  29.14 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  29.78 
 
 
282 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  36.72 
 
 
281 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3668  peptidase M48, Ste24p  29.82 
 
 
273 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  29.78 
 
 
289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  35.93 
 
 
288 aa  112  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  33.59 
 
 
494 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  32.82 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  33.89 
 
 
284 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4104  peptidase M48 Ste24p  29.46 
 
 
316 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  29.92 
 
 
272 aa  108  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  36.64 
 
 
504 aa  108  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  36 
 
 
489 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  31.52 
 
 
268 aa  108  8.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  39.01 
 
 
291 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  29.5 
 
 
279 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  33.21 
 
 
285 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  31.69 
 
 
432 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  36.61 
 
 
311 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  29.12 
 
 
272 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  29.12 
 
 
272 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  30.59 
 
 
269 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  36.02 
 
 
282 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  34.21 
 
 
284 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  35.27 
 
 
489 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0980  peptidase M48 Ste24p  39.08 
 
 
275 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269244  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  34.68 
 
 
489 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  31.31 
 
 
474 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0043  peptidase M48 Ste24p  32.85 
 
 
314 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2637  peptidase M48, Ste24p  36.65 
 
 
302 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  33.06 
 
 
493 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  34.8 
 
 
427 aa  102  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0046  peptidase M48 Ste24p  32.37 
 
 
314 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.330738 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06650  conserved hypothetical protein  36.69 
 
 
418 aa  102  9e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.179039  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  30.04 
 
 
273 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>