More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1396 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1396  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
269 aa  556  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  25.1 
 
 
354 aa  102  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  28.36 
 
 
365 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  26.24 
 
 
280 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  26.86 
 
 
255 aa  90.1  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  25.12 
 
 
395 aa  88.6  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  30.2 
 
 
269 aa  87  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  27.59 
 
 
268 aa  86.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  32.14 
 
 
424 aa  85.5  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  25 
 
 
490 aa  85.5  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  28.48 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  27.63 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  26.07 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  27.57 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  29.73 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  28.29 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  28.29 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  28.29 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  28.29 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  29.05 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  29.05 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0007  peptidase M48 Ste24p  26.51 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  27.36 
 
 
632 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0007  hypothetical protein  26.27 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  27.36 
 
 
632 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  30.43 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  27.36 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  27.14 
 
 
470 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  28.57 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  29.76 
 
 
493 aa  80.5  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  28.3 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0652  M48 family peptidase  27.01 
 
 
426 aa  79.7  0.00000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.59081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  26.34 
 
 
489 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  25.75 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  26.7 
 
 
336 aa  79.3  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  26.81 
 
 
392 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  27.12 
 
 
504 aa  79  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  22.42 
 
 
487 aa  79.3  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  29.56 
 
 
489 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  28.5 
 
 
494 aa  78.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  31.03 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  27.49 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  29.14 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  22.55 
 
 
487 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  22.55 
 
 
487 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  22.55 
 
 
487 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  27.89 
 
 
293 aa  77  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  22.55 
 
 
487 aa  77  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  28.77 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  22.55 
 
 
487 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  22.55 
 
 
487 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  25.86 
 
 
553 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  26.89 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  27.8 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  26.67 
 
 
640 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  25.54 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  25.84 
 
 
488 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  28.93 
 
 
489 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  28.19 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  28.93 
 
 
489 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  29.53 
 
 
497 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  27.66 
 
 
481 aa  75.9  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2400  peptidase M48, Ste24p  25.89 
 
 
550 aa  76.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0992443  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  28.93 
 
 
489 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  22.13 
 
 
487 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  22.13 
 
 
487 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  22.13 
 
 
487 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  22.13 
 
 
487 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  22.13 
 
 
487 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  25.86 
 
 
561 aa  75.9  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  23.63 
 
 
483 aa  75.9  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  28.67 
 
 
347 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  22.13 
 
 
487 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  22.13 
 
 
487 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  22.22 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  28.93 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6469  peptidase M48 Ste24p  32.12 
 
 
573 aa  75.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  22.13 
 
 
487 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  27.23 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  23.18 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  29.38 
 
 
489 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  29.38 
 
 
489 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  22.13 
 
 
487 aa  75.5  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  29.38 
 
 
489 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  29.38 
 
 
489 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  25.74 
 
 
489 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  27.54 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  24.03 
 
 
494 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0056  peptidase M48, Ste24p  22.83 
 
 
461 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  24.03 
 
 
494 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  24.62 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  24.03 
 
 
524 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 
503 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  24.37 
 
 
481 aa  74.7  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  28.76 
 
 
365 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  22.31 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  27.8 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  23.86 
 
 
489 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  28.3 
 
 
485 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>