More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0225 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
290 aa  589  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  71.96 
 
 
289 aa  413  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  54.41 
 
 
269 aa  262  4.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  47.66 
 
 
256 aa  237  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  45.98 
 
 
275 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  38.4 
 
 
252 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  40.95 
 
 
252 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  40.95 
 
 
252 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  42.86 
 
 
253 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  42.86 
 
 
253 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  42.86 
 
 
253 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  42.86 
 
 
253 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  42.86 
 
 
253 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  40.52 
 
 
252 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  41.52 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  40.09 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  40.52 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  40.52 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  40.09 
 
 
252 aa  163  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  40.09 
 
 
252 aa  163  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  41.7 
 
 
249 aa  161  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  39.66 
 
 
252 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  39.66 
 
 
252 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  39.83 
 
 
250 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  39.83 
 
 
250 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  38.98 
 
 
251 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  39.83 
 
 
250 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  41.92 
 
 
250 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  40.44 
 
 
254 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  40.44 
 
 
254 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  40.44 
 
 
254 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  40.44 
 
 
254 aa  152  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  40.44 
 
 
262 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  40.44 
 
 
254 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  40.44 
 
 
254 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  40.44 
 
 
254 aa  152  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  40.44 
 
 
235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  40.76 
 
 
250 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  44.39 
 
 
253 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  40.91 
 
 
252 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  43.85 
 
 
253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  44.92 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  39.19 
 
 
252 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  45.45 
 
 
253 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  39.23 
 
 
312 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  37.12 
 
 
252 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  43.85 
 
 
253 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  43.85 
 
 
253 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  43.85 
 
 
604 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  39.11 
 
 
251 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  41.12 
 
 
250 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  39.73 
 
 
250 aa  136  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  39.35 
 
 
254 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  38.38 
 
 
261 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  30.77 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  29.36 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  33.73 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  31.13 
 
 
529 aa  79  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0980  peptidase M48 Ste24p  29.23 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269244  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  32.95 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  33.73 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  34.34 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  33.33 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  33.13 
 
 
272 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  30.18 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  31.42 
 
 
436 aa  75.9  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  27.91 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  31.95 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  28.32 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  32.94 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  27.91 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  32.95 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  32.08 
 
 
445 aa  73.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  30.54 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  30.25 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
494 aa  71.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  31.9 
 
 
479 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  30.32 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  28.16 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  28.93 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  30.69 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  29.82 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  27.5 
 
 
432 aa  69.7  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  32.73 
 
 
493 aa  69.3  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41270  Peptidase M48, Ste24p family  32.67 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  30.57 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  30.77 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  26.04 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  27.27 
 
 
255 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  27.73 
 
 
424 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  28.74 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  27.17 
 
 
489 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  26.44 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  30.57 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  30.12 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  28.31 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  25.14 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12433  hypothetical protein  29.47 
 
 
274 aa  67  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0709327  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  28.66 
 
 
453 aa  66.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  28.05 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>