More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2687 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  100 
 
 
254 aa  519  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  99.61 
 
 
254 aa  517  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  99.61 
 
 
254 aa  517  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
254 aa  519  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  100 
 
 
254 aa  519  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  100 
 
 
254 aa  519  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  99.61 
 
 
262 aa  518  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  519  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  100 
 
 
235 aa  481  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  70.47 
 
 
253 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  70.47 
 
 
253 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  70.47 
 
 
253 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  70.47 
 
 
253 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  70.47 
 
 
253 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  62.55 
 
 
250 aa  321  8e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  59.84 
 
 
250 aa  320  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  62.14 
 
 
250 aa  320  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  62.14 
 
 
250 aa  320  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  60.63 
 
 
250 aa  308  5e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  59.13 
 
 
252 aa  304  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  59.13 
 
 
252 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  57.14 
 
 
252 aa  299  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  57.14 
 
 
252 aa  299  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  57.14 
 
 
252 aa  299  3e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  57.14 
 
 
252 aa  299  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  57.14 
 
 
252 aa  298  4e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  56.75 
 
 
252 aa  297  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  56.75 
 
 
252 aa  297  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  56.75 
 
 
252 aa  297  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  57.2 
 
 
252 aa  286  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  59.84 
 
 
250 aa  285  5.999999999999999e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  60 
 
 
252 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  53.54 
 
 
251 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  61.18 
 
 
252 aa  278  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  60.34 
 
 
252 aa  275  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  57.85 
 
 
251 aa  265  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  56.76 
 
 
249 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  55.6 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  56.02 
 
 
253 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  54.77 
 
 
253 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  52.7 
 
 
250 aa  247  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  56.02 
 
 
253 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  56.02 
 
 
253 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  53.6 
 
 
604 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  53.94 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  56.78 
 
 
250 aa  237  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  52.61 
 
 
254 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  52.44 
 
 
261 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  43.08 
 
 
256 aa  189  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  39.24 
 
 
312 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  41.36 
 
 
275 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  42.92 
 
 
289 aa  167  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  39.53 
 
 
269 aa  163  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  41.78 
 
 
290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  29.73 
 
 
424 aa  94  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  29.66 
 
 
264 aa  90.1  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  34.66 
 
 
280 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  32.79 
 
 
445 aa  85.9  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  32.91 
 
 
447 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  28.96 
 
 
475 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  27.52 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  26.42 
 
 
279 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  32.18 
 
 
365 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  26.42 
 
 
279 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  24 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  26.15 
 
 
453 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  25.48 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  24.8 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  31.49 
 
 
529 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  25.1 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  32.75 
 
 
432 aa  75.1  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  29.45 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  25.87 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  25.32 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  31.41 
 
 
442 aa  73.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  24.86 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  29.32 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  27.81 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  24.3 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  26.42 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  28.57 
 
 
436 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  26.61 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  27.73 
 
 
483 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  25 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  25.23 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  24.02 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  23.97 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  31.09 
 
 
565 aa  69.3  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  26.97 
 
 
423 aa  68.9  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  29.03 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 
483 aa  68.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  24.81 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  27.68 
 
 
284 aa  68.9  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  26.56 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  23.44 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  29.22 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  24.22 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  22.69 
 
 
267 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  30.13 
 
 
265 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  24.41 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>