More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0117 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
275 aa  551  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  46.93 
 
 
312 aa  186  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  45.75 
 
 
251 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  43.23 
 
 
256 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  45.04 
 
 
250 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  41.7 
 
 
250 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  44.91 
 
 
269 aa  176  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  41.7 
 
 
250 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  41.7 
 
 
250 aa  175  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  45.29 
 
 
252 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  43.59 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  41.56 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  44.84 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  43.95 
 
 
252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  43.95 
 
 
252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0200008 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  43.95 
 
 
252 aa  171  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  45.98 
 
 
290 aa  171  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  43.95 
 
 
252 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  43.95 
 
 
252 aa  171  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  43.95 
 
 
252 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  43.5 
 
 
249 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  43.95 
 
 
252 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  43.95 
 
 
252 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  40.97 
 
 
254 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  40.97 
 
 
254 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  40.97 
 
 
254 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  40.97 
 
 
254 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  40.97 
 
 
254 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  40.97 
 
 
254 aa  169  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  46.45 
 
 
252 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  40.97 
 
 
262 aa  169  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  40.97 
 
 
235 aa  169  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  43.19 
 
 
253 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  43.19 
 
 
253 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  43.19 
 
 
253 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  43.19 
 
 
253 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  43.19 
 
 
253 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  40.53 
 
 
254 aa  168  9e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  42.79 
 
 
250 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  45.92 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  42.41 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  43.05 
 
 
253 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  44.6 
 
 
252 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  41.78 
 
 
289 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  47.96 
 
 
253 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  47.96 
 
 
253 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  44.13 
 
 
252 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  44.9 
 
 
604 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  42.42 
 
 
252 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  44.68 
 
 
261 aa  155  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  43.87 
 
 
251 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  47.96 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  43.17 
 
 
254 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  42.15 
 
 
250 aa  149  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  30.59 
 
 
489 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  32.04 
 
 
489 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  31.79 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  28.11 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  30.94 
 
 
489 aa  82.4  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  32.39 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  30.39 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  32.75 
 
 
493 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  29.44 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  30.05 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  28.98 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  30.2 
 
 
442 aa  79.7  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  28.44 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  26.77 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  34.32 
 
 
445 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  26.77 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  34.21 
 
 
513 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  34.42 
 
 
289 aa  77  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  29.44 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  29.95 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  32.51 
 
 
479 aa  76.6  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  28.11 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  26.92 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  32.4 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  33.17 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  28.63 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  24.65 
 
 
492 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  28.31 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  29.63 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  27.46 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  27.56 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  25.86 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  30.89 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  31.46 
 
 
453 aa  72  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  30.23 
 
 
493 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  32.83 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  28.78 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  30.15 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  27.2 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  30.85 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  32.32 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  30.73 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  30.73 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  32.32 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  32.26 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>