More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2139 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 251 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  64.54 
 
 		 250 aa  332  5e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  64.68 
 
 		 250 aa  316  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  60.71 
 
 		 250 aa  315  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  60.71 
 
 		 250 aa  314  7e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  60.32 
 
 		 250 aa  313  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  66.23 
 
 		 252 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  61.35 
 
 		 252 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  61.35 
 
 		 252 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  61.35 
 
 		 252 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  61.35 
 
 		 252 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  61.35 
 
 		 252 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  61.35 
 
 		 252 aa  308  6.999999999999999e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  60.96 
 
 		 252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  60.96 
 
 		 252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  66.67 
 
 		 252 aa  305  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  60.16 
 
 		 252 aa  301  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  60.16 
 
 		 252 aa  301  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  57.2 
 
 		 251 aa  298  6e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  58.57 
 
 		 253 aa  296  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  58.17 
 
 		 253 aa  295  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  58.17 
 
 		 253 aa  295  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  58.17 
 
 		 253 aa  295  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  58.17 
 
 		 253 aa  295  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  60.16 
 
 		 252 aa  291  8e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  63.49 
 
 		 250 aa  291  8e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  63.84 
 
 		 249 aa  291  9e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  59.83 
 
 		 250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  57.61 
 
 		 262 aa  285  4e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  57.85 
 
 		 254 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  57.85 
 
 		 254 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  57.85 
 
 		 254 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  57.85 
 
 		 254 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  57.85 
 
 		 254 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  60.52 
 
 		 252 aa  285  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  57.44 
 
 		 254 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  57.63 
 
 		 254 aa  278  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  59.01 
 
 		 235 aa  271  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  60.44 
 
 		 261 aa  259  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  60.26 
 
 		 250 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  54.72 
 
 		 254 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  54.47 
 
 		 253 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  54.15 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  54.07 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  55.34 
 
 		 253 aa  241  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  52.96 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  52.96 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  52.96 
 
 		 604 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  47.33 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  40.93 
 
 		 312 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  46.23 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  37.4 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  42.13 
 
 		 269 aa  153  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  40.44 
 
 		 290 aa  152  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  29.77 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  29.96 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  27.03 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  28.24 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  28.34 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  24.44 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  26.45 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  28.79 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  28.79 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  27.84 
 
 		 267 aa  72  0.000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  26.07 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  26.82 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  28.4 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  28.4 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  26.2 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  26.14 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  31.95 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  32.12 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  31.25 
 
 		 479 aa  69.3  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  25.93 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  26.73 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  25.93 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  26.92 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  30.87 
 
 		 335 aa  68.6  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  30.69 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  32.26 
 
 		 481 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  27.96 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  29.22 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  22.01 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  30.11 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  28.77 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  29.1 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0058  peptidase M48 Ste24p  25.48 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  22.01 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  27.27 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  26.83 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  26.89 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  25.29 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  32.5 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  27.5 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  32.92 
 
 		 483 aa  65.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  26.48 
 
 		 311 aa  65.1  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  25.81 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  27.56 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  27.8 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  25.3 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>