More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3335 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 252 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  80.56 
 
 		 251 aa  421  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  64.43 
 
 		 250 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  64.43 
 
 		 250 aa  339  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  65.61 
 
 		 250 aa  338  4e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  64.03 
 
 		 250 aa  338  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  61.9 
 
 		 252 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  61.51 
 
 		 252 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  63.6 
 
 		 250 aa  310  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  57.94 
 
 		 252 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  58.73 
 
 		 253 aa  303  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  57.94 
 
 		 252 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  57.94 
 
 		 252 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  58.73 
 
 		 253 aa  303  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  57.94 
 
 		 252 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  58.73 
 
 		 253 aa  303  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  58.73 
 
 		 253 aa  303  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  57.94 
 
 		 252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  57.94 
 
 		 252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  57.94 
 
 		 252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  57.54 
 
 		 252 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  58.33 
 
 		 253 aa  301  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  57.87 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  57.87 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  57.87 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  57.87 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  57.87 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  57.48 
 
 		 262 aa  299  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  57.48 
 
 		 254 aa  298  6e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  65.71 
 
 		 253 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  65.31 
 
 		 253 aa  295  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  59.92 
 
 		 252 aa  295  6e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  60 
 
 		 254 aa  293  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  60.09 
 
 		 235 aa  289  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  64.49 
 
 		 253 aa  289  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  59.32 
 
 		 252 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  63.48 
 
 		 249 aa  285  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  58.47 
 
 		 252 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  58.43 
 
 		 250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  65.31 
 
 		 253 aa  280  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  64.08 
 
 		 253 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  64.08 
 
 		 253 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  57.77 
 
 		 251 aa  278  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  63.6 
 
 		 250 aa  278  6e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  65.64 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  64.08 
 
 		 604 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  58.13 
 
 		 254 aa  247  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  57.74 
 
 		 261 aa  245  6e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  42.62 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  46.45 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  41 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  42.52 
 
 		 269 aa  164  9e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  38.97 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  41.36 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  28.96 
 
 		 268 aa  85.5  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  28.9 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  29.43 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  31.55 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  26.54 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  25.85 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  28.02 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  26.51 
 
 		 424 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  27.1 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  27.54 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  26.07 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  27.49 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  33.12 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  29.68 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  30.21 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  30.21 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  27.75 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  29.15 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  26.78 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  26.04 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  28.25 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  29.11 
 
 		 263 aa  75.1  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  26.15 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  24.23 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  29.86 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  29.63 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  28.5 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  26.4 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  29.36 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  28.5 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  28.5 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  34.19 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  32.48 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  30.48 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  25.1 
 
 		 269 aa  72  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 496 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  26.89 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0147  peptidase M48, Ste24p  30.87 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  26.5 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  28 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  26 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  26.34 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  28.38 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  27.17 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0332  peptidase M48 Ste24p  27.95 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>