More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0332 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0332  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 422 aa  847    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4392  hypothetical protein  95.42 
 
 		 266 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.863393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0058  peptidase M48 Ste24p  63.96 
 
 		 404 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3040  peptidase M48 Ste24p  57.24 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.359784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6453  peptidase M48, Ste24p  59.85 
 
 		 353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2488  peptidase M48, Ste24p  57.09 
 
 		 350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3157  peptidase M48, Ste24p  57.59 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3102  peptidase M48, Ste24p  57.09 
 
 		 350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3118  peptidase M48 Ste24p  56.74 
 
 		 350 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3099  peptidase M48 Ste24p  57.5 
 
 		 349 aa  332  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0154  M48 family peptidase  55.6 
 
 		 346 aa  296  7e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0189  hypothetical protein  55.42 
 
 		 350 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3444  hypothetical protein  55.16 
 
 		 347 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2185  hypothetical protein  55.16 
 
 		 347 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0179  hypothetical protein  55.47 
 
 		 351 aa  292  7e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308027  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2904  hypothetical protein  55.2 
 
 		 344 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3243  hypothetical protein  55.2 
 
 		 316 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0374  M48 family peptidase  55.47 
 
 		 350 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0192  peptidase M48, Ste24p  42.32 
 
 		 319 aa  252  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.461964  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  39.2 
 
 		 311 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  38.44 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  39.04 
 
 		 291 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0153  putative signal peptide protein  42.45 
 
 		 314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700817  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  41.88 
 
 		 284 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2637  peptidase M48, Ste24p  42.8 
 
 		 302 aa  210  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0093  putative signal peptide protein  40.42 
 
 		 340 aa  206  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485946  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0147  peptidase M48, Ste24p  39.11 
 
 		 284 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  39.36 
 
 		 288 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0046  peptidase M48 Ste24p  41.22 
 
 		 314 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.330738 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0043  peptidase M48 Ste24p  41.22 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  42.26 
 
 		 281 aa  204  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  37.82 
 
 		 280 aa  193  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4104  peptidase M48 Ste24p  39.67 
 
 		 316 aa  190  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0153  peptidase M48, Ste24p  36.32 
 
 		 280 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0497682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  39.22 
 
 		 274 aa  170  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  37.07 
 
 		 289 aa  159  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  35.9 
 
 		 273 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  36.64 
 
 		 267 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  35.9 
 
 		 273 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  34.96 
 
 		 271 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  39.57 
 
 		 280 aa  153  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  33.48 
 
 		 268 aa  151  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  35.19 
 
 		 270 aa  150  5e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  36.13 
 
 		 271 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  34.18 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  34.18 
 
 		 279 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  34.18 
 
 		 272 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  35.16 
 
 		 282 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  37.75 
 
 		 270 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  33.61 
 
 		 272 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  36.21 
 
 		 258 aa  144  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  35.78 
 
 		 272 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0018  peptidase M48, Ste24p  33.62 
 
 		 272 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  33.33 
 
 		 267 aa  139  7e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  35.42 
 
 		 270 aa  139  7e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41270  Peptidase M48, Ste24p family  35.05 
 
 		 273 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3668  peptidase M48, Ste24p  31.2 
 
 		 273 aa  136  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  33.19 
 
 		 268 aa  125  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  31.13 
 
 		 285 aa  122  9e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  31.9 
 
 		 268 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  29.69 
 
 		 254 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  30.08 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0980  peptidase M48 Ste24p  32.55 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269244  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  35.58 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  39.44 
 
 		 231 aa  113  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  34.78 
 
 		 263 aa  112  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  34.86 
 
 		 270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  30.7 
 
 		 268 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  32.07 
 
 		 262 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  31.58 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  30.4 
 
 		 275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  30.74 
 
 		 255 aa  110  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  37.3 
 
 		 266 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  37.58 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  28.46 
 
 		 265 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  26.47 
 
 		 267 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  31.22 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  33.8 
 
 		 265 aa  106  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  38.55 
 
 		 265 aa  106  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  31.18 
 
 		 293 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  32.96 
 
 		 268 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  33.87 
 
 		 259 aa  104  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  35.63 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  35.96 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1406  peptidase M48 Ste24p  28.03 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  34.25 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  29.54 
 
 		 271 aa  101  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12433  hypothetical protein  33.72 
 
 		 274 aa  99.8  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0709327  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2450  peptidase M48, Ste24p  35.07 
 
 		 264 aa  99.8  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.195879  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  33.85 
 
 		 269 aa  100  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 269 aa  99.8  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  31.1 
 
 		 268 aa  99.8  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  27.57 
 
 		 269 aa  99.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 269 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2760  peptidase M48 Ste24p  33.91 
 
 		 298 aa  97.8  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.293753  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  35.03 
 
 		 266 aa  98.2  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  33.52 
 
 		 269 aa  96.3  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 272 aa  96.7  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  31.49 
 
 		 320 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  34.81 
 
 		 269 aa  92.4  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>