More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0474 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
261 aa  525  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  60.96 
 
 
249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  57.2 
 
 
251 aa  274  9e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  53.91 
 
 
250 aa  272  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  53.91 
 
 
250 aa  272  5.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  54.3 
 
 
250 aa  271  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  55.28 
 
 
250 aa  271  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  53.94 
 
 
252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  53.94 
 
 
252 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  56.64 
 
 
250 aa  268  5e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  58.37 
 
 
251 aa  268  7e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  52.76 
 
 
253 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  52.36 
 
 
253 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  52.36 
 
 
253 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  52.36 
 
 
253 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  52.36 
 
 
253 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  57.74 
 
 
252 aa  262  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  55.86 
 
 
254 aa  260  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.254413 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  51.57 
 
 
252 aa  257  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  51.57 
 
 
252 aa  257  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  51.57 
 
 
252 aa  257  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  51.57 
 
 
252 aa  257  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  63.84 
 
 
250 aa  257  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  51.57 
 
 
252 aa  257  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  51.57 
 
 
252 aa  257  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  51.18 
 
 
252 aa  255  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  51.18 
 
 
252 aa  255  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  60.08 
 
 
253 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  55.38 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  59.26 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  60.08 
 
 
253 aa  251  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  57.14 
 
 
252 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  58.04 
 
 
252 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  50.97 
 
 
254 aa  248  5e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  50.97 
 
 
254 aa  248  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  50.97 
 
 
254 aa  248  5e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  50.97 
 
 
254 aa  248  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  50.97 
 
 
254 aa  248  5e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  51.97 
 
 
252 aa  248  6e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  52.02 
 
 
262 aa  247  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  50.58 
 
 
254 aa  246  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  59.26 
 
 
253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  55.47 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  54.22 
 
 
254 aa  241  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  54.22 
 
 
235 aa  242  6e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  58.02 
 
 
253 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  58.02 
 
 
253 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  58.02 
 
 
604 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  46.02 
 
 
275 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  38.93 
 
 
312 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  37.55 
 
 
256 aa  163  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  35.02 
 
 
290 aa  136  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  34.71 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  37.96 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  25.09 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  29.72 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  29.72 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  29.03 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  29.72 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  29.44 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  28.02 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  30.66 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  29.25 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  26.32 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  28.46 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  26.54 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  32.54 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  29.72 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  30.19 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  27.97 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  27.36 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  32.7 
 
 
365 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  32 
 
 
605 aa  76.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  29.72 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  28.02 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  27.49 
 
 
266 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  31.82 
 
 
573 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  28.44 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  25.59 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  32.03 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  26.77 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  26.51 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  28.83 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  31.84 
 
 
289 aa  72  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  31.77 
 
 
273 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  25.58 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0679  peptidase M48 Ste24p  29.26 
 
 
472 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  28.81 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  26.85 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  29.94 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  29.11 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  26.27 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  26.67 
 
 
424 aa  69.3  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  29.11 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  25.28 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  27.13 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  27.3 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  30.73 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  34.38 
 
 
479 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>