More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2807 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 253 aa  517  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  98.02 
 
 		 253 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  93.28 
 
 		 253 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  92.49 
 
 		 604 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  90.12 
 
 		 253 aa  427  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  92.49 
 
 		 253 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  92.49 
 
 		 253 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  63.2 
 
 		 251 aa  322  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  66.38 
 
 		 252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  55.34 
 
 		 250 aa  293  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  62.5 
 
 		 249 aa  292  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  54.98 
 
 		 250 aa  287  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  54.98 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  59.66 
 
 		 250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  54.58 
 
 		 250 aa  285  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  54.18 
 
 		 252 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  54.18 
 
 		 252 aa  284  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  57.37 
 
 		 250 aa  281  6.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  56.02 
 
 		 262 aa  281  9e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  64.41 
 
 		 250 aa  281  9e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  56.02 
 
 		 254 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  56.02 
 
 		 254 aa  281  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  56.02 
 
 		 254 aa  281  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  56.02 
 
 		 254 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  56.02 
 
 		 254 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  55.83 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  55.83 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  55.83 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  55.83 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  55.42 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  55.2 
 
 		 252 aa  279  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  55.6 
 
 		 254 aa  278  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  52.59 
 
 		 252 aa  278  8e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  52.59 
 
 		 252 aa  278  8e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  52.59 
 
 		 252 aa  278  9e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  52.59 
 
 		 252 aa  278  9e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  52.59 
 
 		 252 aa  277  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  52.59 
 
 		 252 aa  277  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  52.59 
 
 		 252 aa  277  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  55.7 
 
 		 254 aa  276  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  52.19 
 
 		 252 aa  276  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  57.21 
 
 		 235 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  56.75 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  56.28 
 
 		 252 aa  254  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  56.18 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  56.71 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  54.07 
 
 		 251 aa  245  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  61.06 
 
 		 261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  45.74 
 
 		 275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  42.56 
 
 		 312 aa  185  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  38.93 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  41.13 
 
 		 269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  43.52 
 
 		 290 aa  165  8e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  41.67 
 
 		 289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  30.99 
 
 		 268 aa  92.8  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  26.52 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  26.14 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  32.93 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  23.36 
 
 		 424 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  29.32 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  27.38 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  31.45 
 
 		 274 aa  78.6  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  28.5 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  31.12 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  32.73 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  26.64 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  27.24 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  30 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  30.77 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  32.5 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  27.34 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  29.66 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  29.44 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  29.67 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  30.08 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  30.08 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  30.08 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  30.65 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  30.49 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  27.22 
 
 		 271 aa  72  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  29.86 
 
 		 258 aa  72  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  27.23 
 
 		 280 aa  72  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  28.99 
 
 		 280 aa  72  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  24.89 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  28.3 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  31.29 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  30.91 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  27.89 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  30.13 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  29.75 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  29.75 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  27.91 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  29.75 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  29.14 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2687  peptidase M48, Ste24p  27.72 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  28.75 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  29.75 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  28.57 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  29.28 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  26.29 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>