56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1400 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1400  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 441 aa  875    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.42624  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2040  peptidase M48 Ste24p  67.05 
 
 		 287 aa  363  5.0000000000000005e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02570  Zn-dependent protease with chaperone function  52.52 
 
 		 441 aa  289  7e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0289  peptidase M48 Ste24p  51.75 
 
 		 256 aa  263  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2436  hypothetical protein  51.35 
 
 		 265 aa  243  7e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0385312  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4397  peptidase M48 Ste24p  38.98 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2481  hypothetical protein  35.11 
 
 		 267 aa  160  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.250784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1164  peptidase M48 Ste24p  30.71 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3013  peptidase M48 Ste24p  34 
 
 		 447 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2928  peptidase M48, Ste24p  34 
 
 		 447 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368018  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0113  peptidase M48 Ste24p  26.92 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0114  peptidase M48 Ste24p  29.67 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3120  peptidase M48 Ste24p  34 
 
 		 447 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4244  peptidase M48 Ste24p  29.67 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0109  peptidase M48 Ste24p  29.67 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0110  protease  27.31 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0111  peptidase M48, Ste24p  27.69 
 
 		 447 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946987 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0111  peptidase M48, Ste24p  27.68 
 
 		 447 aa  106  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0107  peptidase M48, Ste24p  28 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0106  peptidase M48, Ste24p  27.31 
 
 		 447 aa  104  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3361  peptidase M48 Ste24p  40.45 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2172  hypothetical protein  28.5 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2707  hypothetical protein  29.05 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.467935  normal  0.741997 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1553  peptidase M48 Ste24p  30.66 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.955824  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5870  peptidase M48 Ste24p  26.19 
 
 		 344 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1421  peptidase M48, Ste24p  28.77 
 
 		 383 aa  54.3  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  28.16 
 
 		 252 aa  51.6  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  27.59 
 
 		 252 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  27.42 
 
 		 252 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  27.59 
 
 		 252 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  27.59 
 
 		 252 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  27.42 
 
 		 252 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  27.59 
 
 		 252 aa  48.9  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  27.59 
 
 		 252 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  27.59 
 
 		 252 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  27.59 
 
 		 252 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  27.59 
 
 		 252 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4955  peptidase M48 Ste24p  27.01 
 
 		 364 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  28.11 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0795  peptidase M48 Ste24p  28.01 
 
 		 274 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  34.21 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33120  Zn-dependent protease with chaperone function  28.02 
 
 		 348 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129861  normal  0.563955 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  28.11 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  28.11 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  28.11 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7262  peptidase M48 Ste24p  27.52 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5984  peptidase M48 Ste24p  29.89 
 
 		 318 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.968266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  22.56 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  33.65 
 
 		 268 aa  44.3  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0637  peptidase M48  30.19 
 
 		 320 aa  43.9  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0399964  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  28.47 
 
 		 254 aa  43.9  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  28.95 
 
 		 604 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  31.5 
 
 		 504 aa  43.1  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  30.19 
 
 		 253 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  30.19 
 
 		 253 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  47.27 
 
 		 263 aa  43.1  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>