33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1350 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1350  peptidase M56, BlaR1  100 
 
 		 260 aa  526  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.205977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0291  hypothetical protein  29.74 
 
 		 328 aa  78.6  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.497447  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4097  peptidase M56 BlaR1  31.79 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2522  peptidase M56, BlaR1  29.49 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4387  peptidase M56, BlaR1  25.4 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567369 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00308  peptidase M56, BlaR1  29.5 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3998  peptidase M56, BlaR1  25.2 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1791  hypothetical protein  25.6 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3553  hypothetical protein  25.12 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31050  hypothetical protein  30.77 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000019921  unclonable  2.92536e-22 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0499  hypothetical protein  33.79 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1645  peptidase M56 BlaR1  24.26 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3493  peptidase M56 BlaR1  25.73 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2623  peptidase M56 BlaR1  25.73 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0123908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1903  hypothetical protein  24.04 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000423406  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3768  hypothetical protein  32.16 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1595  cell surface protein  23.41 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1827  hypothetical protein  23.41 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1646  hypothetical protein  23.41 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000626927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1777  hypothetical protein  23.41 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1625  cell surface protein  23.19 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000608951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1850  hypothetical protein  23.56 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00976816  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4390  peptidase M56 BlaR1  29.56 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4281  hypothetical protein  27.78 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1963  peptidase M56 BlaR1  27.4 
 
 		 330 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321633  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1878  peptidase M56 BlaR1  26.71 
 
 		 330 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101036  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2000  peptidase M56, BlaR1  25.47 
 
 		 330 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2565  hypothetical protein  23.57 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.768992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7262  peptidase M48 Ste24p  32.35 
 
 		 358 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1947  peptidase M48 Ste24p  29.66 
 
 		 370 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4396  peptidase M48, Ste24p  36.36 
 
 		 364 aa  43.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0183  hypothetical protein  29.47 
 
 		 281 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  31.19 
 
 		 319 aa  42  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>