35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3878 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3878  TonB-like protein  100 
 
 		 261 aa  524  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.781736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  44.74 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3657  hypothetical protein  33.73 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  40.54 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4364  hypothetical protein  33.63 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  32.47 
 
 		 112 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  37.8 
 
 		 859 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  35.53 
 
 		 249 aa  52.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1604  TonB family protein  42.22 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013758  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  33.77 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1509  TonB family protein  42.22 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00129543  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  32.56 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  43.59 
 
 		 221 aa  49.7  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  43.59 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  32.88 
 
 		 582 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  33.77 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  38.96 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  34.18 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  32.91 
 
 		 244 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  32.91 
 
 		 244 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  38.16 
 
 		 233 aa  46.2  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  29.92 
 
 		 206 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  37.97 
 
 		 184 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  41.67 
 
 		 458 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  36.51 
 
 		 349 aa  43.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  33.33 
 
 		 249 aa  43.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  32.5 
 
 		 206 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  37.66 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  28.57 
 
 		 206 aa  42.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.8 
 
 		 459 aa  42.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2087  TonB family protein  32.18 
 
 		 219 aa  42.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.000490312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  33.33 
 
 		 207 aa  42  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0038  TonB-like protein  29.73 
 
 		 362 aa  42  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  32.1 
 
 		 206 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  32.5 
 
 		 206 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>