29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1643 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1643  TonB family protein  100 
 
 		 337 aa  665    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0339167  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1487  TonB family protein  35.16 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.39629 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  27.78 
 
 		 264 aa  53.5  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  31.58 
 
 		 237 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  35.56 
 
 		 279 aa  51.2  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  33.33 
 
 		 251 aa  50.1  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  31.11 
 
 		 285 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  29.67 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  31.96 
 
 		 296 aa  47.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  36.05 
 
 		 243 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  36.05 
 
 		 243 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  36.05 
 
 		 243 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  29.35 
 
 		 292 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  53.49 
 
 		 292 aa  46.6  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  39.29 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  32.86 
 
 		 248 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  32.35 
 
 		 248 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  27.17 
 
 		 292 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0930  TonB family protein  31.76 
 
 		 446 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  44.19 
 
 		 270 aa  43.5  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  46.3 
 
 		 164 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  36 
 
 		 244 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  24.88 
 
 		 297 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  52.17 
 
 		 202 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  27.17 
 
 		 286 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1499  TonB family protein  20.18 
 
 		 281 aa  42.7  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  31.31 
 
 		 250 aa  42.7  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2668  TonB family protein  41.51 
 
 		 252 aa  42.4  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2717  TonB family protein  20.18 
 
 		 281 aa  42.4  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>