27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2711 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2711  GETHR pentapeptide  100 
 
 		 654 aa  1212    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.653885  hitchhiker  0.000850272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  40 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  38.18 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  39.39 
 
 		 297 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  39.39 
 
 		 319 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  40 
 
 		 297 aa  72  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0537  TonB-like  41.84 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  38.71 
 
 		 297 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  38.71 
 
 		 300 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  37.25 
 
 		 299 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  38.24 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  38.24 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  34.04 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  38.24 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  35.92 
 
 		 292 aa  66.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  36.36 
 
 		 298 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  37.76 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  36.27 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  46.15 
 
 		 250 aa  62.8  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  34.74 
 
 		 310 aa  62  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  40.32 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2286  hypothetical protein  28.92 
 
 		 456 aa  60.1  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  36.56 
 
 		 294 aa  59.7  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.09 
 
 		 643 aa  56.6  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.67 
 
 		 453 aa  55.1  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01600  TonB protein  43.55 
 
 		 291 aa  46.2  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  30.43 
 
 		 2397 aa  45.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>