83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02323 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02323  peptidase, M56 family protein  100 
 
 		 361 aa  707    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.321617  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  35.29 
 
 		 413 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  42.69 
 
 		 590 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  30.86 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  36.21 
 
 		 403 aa  136  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3883  peptidase M56 BlaR1  38.43 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  28.81 
 
 		 417 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  26.23 
 
 		 404 aa  125  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  26.14 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  28.05 
 
 		 462 aa  92  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0360  peptidase M56, BlaR1  32.14 
 
 		 557 aa  90.1  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  34.04 
 
 		 728 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  26.97 
 
 		 719 aa  73.9  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  22.53 
 
 		 465 aa  73.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  25.32 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  36.59 
 
 		 596 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  29.88 
 
 		 647 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  25.97 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  31.48 
 
 		 614 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  26.92 
 
 		 754 aa  63.5  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  32.1 
 
 		 617 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  29.05 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  27.27 
 
 		 541 aa  60.5  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  24.83 
 
 		 747 aa  59.7  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  25.29 
 
 		 858 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  28.3 
 
 		 598 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  25 
 
 		 589 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  30.87 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  33.7 
 
 		 619 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  25 
 
 		 629 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  25 
 
 		 632 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  25 
 
 		 629 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  23.61 
 
 		 640 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  22.06 
 
 		 632 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  28.26 
 
 		 631 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  29.29 
 
 		 671 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  28.72 
 
 		 423 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  29.01 
 
 		 482 aa  51.6  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  32.22 
 
 		 750 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3210  peptidase M56, BlaR1  26.76 
 
 		 672 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  41.38 
 
 		 390 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  26.14 
 
 		 647 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  27.27 
 
 		 700 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  46.81 
 
 		 371 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  28.93 
 
 		 477 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1355  peptidase M56 BlaR1  22.77 
 
 		 519 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  30 
 
 		 750 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  46.81 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0077  peptidase M56 BlaR1  33.64 
 
 		 664 aa  47.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.559375 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3430  peptidase M56 BlaR1  39.29 
 
 		 447 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  27.78 
 
 		 585 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  27.78 
 
 		 585 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  31.58 
 
 		 223 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  27.78 
 
 		 585 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3668  peptidase M56 BlaR1  31.43 
 
 		 509 aa  47  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  40.38 
 
 		 334 aa  46.6  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  42.55 
 
 		 223 aa  46.6  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  39.34 
 
 		 259 aa  46.2  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  26.98 
 
 		 447 aa  46.2  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  18.68 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  40 
 
 		 184 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  29.17 
 
 		 660 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  40.82 
 
 		 467 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3134  BlaR1 peptidase M56 domain protein  33.94 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  38.46 
 
 		 244 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  24.24 
 
 		 651 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  25.19 
 
 		 581 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  38.46 
 
 		 239 aa  43.9  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  38.46 
 
 		 239 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  38.46 
 
 		 239 aa  43.9  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  38.46 
 
 		 243 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  38.46 
 
 		 244 aa  43.9  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  38.46 
 
 		 239 aa  43.9  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  38.46 
 
 		 239 aa  43.9  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  38.46 
 
 		 239 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  40 
 
 		 221 aa  43.9  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  40 
 
 		 221 aa  43.9  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0712  TonB family protein  30.12 
 
 		 110 aa  43.5  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.877696  normal  0.702571 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  31.46 
 
 		 219 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  26.06 
 
 		 649 aa  43.5  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  36.54 
 
 		 260 aa  43.1  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07465  hypothetical protein  24.39 
 
 		 563 aa  43.1  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1645  peptidase M56 BlaR1  22.52 
 
 		 270 aa  42.7  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>