28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0164 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0164  peptidase M56 BlaR1  100 
 
 
210 aa  417  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285582  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  50.22 
 
 
719 aa  250  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  44.98 
 
 
322 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  43.91 
 
 
462 aa  194  8.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  40.93 
 
 
728 aa  183  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  39.59 
 
 
614 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1474  hypothetical protein  56.72 
 
 
81 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  44.62 
 
 
754 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  25.64 
 
 
302 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  24.41 
 
 
747 aa  65.5  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  41.18 
 
 
442 aa  61.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  26.54 
 
 
617 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2323  penicillin binding protein  57.58 
 
 
72 aa  53.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  22.62 
 
 
750 aa  52  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  34.33 
 
 
858 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  37.5 
 
 
397 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  37.5 
 
 
647 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1355  peptidase M56 BlaR1  46.81 
 
 
519 aa  46.2  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  32.84 
 
 
562 aa  45.4  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  39.29 
 
 
423 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  37.88 
 
 
632 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  34.72 
 
 
404 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  30.91 
 
 
632 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  29.41 
 
 
405 aa  42  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  36.67 
 
 
671 aa  42  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  29.09 
 
 
640 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3733  peptidase M56 BlaR1  39.29 
 
 
596 aa  41.6  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  30.3 
 
 
417 aa  41.6  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>