More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1589 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006365  plpp0076  hypothetical protein  67.35 
 
 
640 aa  902    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0823761  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1589  hypothetical protein  100 
 
 
636 aa  1309    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1404  hypothetical protein  96.07 
 
 
636 aa  1220    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.95 
 
 
570 aa  127  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.55 
 
 
710 aa  124  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1498  peptidoglycan glycosyltransferase  29.13 
 
 
556 aa  123  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00439152  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  29.74 
 
 
708 aa  120  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  29.67 
 
 
553 aa  120  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.09 
 
 
583 aa  118  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.45 
 
 
645 aa  117  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  29.13 
 
 
656 aa  117  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  31.21 
 
 
727 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  28.22 
 
 
586 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  28.4 
 
 
577 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  29.12 
 
 
695 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.49 
 
 
577 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  28.36 
 
 
578 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  27.49 
 
 
657 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  29.52 
 
 
675 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  28.61 
 
 
584 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  28.61 
 
 
584 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.61 
 
 
584 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  28.61 
 
 
584 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  28.53 
 
 
649 aa  111  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.17 
 
 
644 aa  110  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  26.36 
 
 
580 aa  110  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  29.17 
 
 
587 aa  109  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  29.76 
 
 
570 aa  109  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.29 
 
 
657 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.63 
 
 
654 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  28.44 
 
 
583 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  28.44 
 
 
583 aa  109  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  28.44 
 
 
583 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  28.06 
 
 
587 aa  108  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  28.02 
 
 
578 aa  108  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  29.25 
 
 
583 aa  107  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  28.44 
 
 
583 aa  107  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  27.43 
 
 
578 aa  105  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  28.74 
 
 
579 aa  105  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  28.74 
 
 
579 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.09 
 
 
571 aa  104  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  29.45 
 
 
618 aa  104  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  27.84 
 
 
660 aa  104  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  27.78 
 
 
690 aa  103  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  28.1 
 
 
719 aa  103  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  29.17 
 
 
630 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  28.87 
 
 
630 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  28.45 
 
 
682 aa  103  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  29.38 
 
 
631 aa  103  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  29.08 
 
 
632 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  29.08 
 
 
632 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  29.08 
 
 
632 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  27.79 
 
 
657 aa  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  28.65 
 
 
705 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  27.57 
 
 
575 aa  102  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  28.87 
 
 
642 aa  102  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  27.49 
 
 
596 aa  102  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  27.88 
 
 
657 aa  102  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  28.24 
 
 
740 aa  101  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.56 
 
 
654 aa  101  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  27.81 
 
 
578 aa  101  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  27.43 
 
 
578 aa  100  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3134  BlaR1 peptidase M56 domain protein  25.4 
 
 
381 aa  100  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  28.17 
 
 
582 aa  99.4  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.208475  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.1 
 
 
670 aa  99.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  28.17 
 
 
582 aa  99.4  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0254868  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  29.13 
 
 
548 aa  99.4  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  26.27 
 
 
644 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  27.08 
 
 
642 aa  99.4  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  26.84 
 
 
578 aa  99.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  29.13 
 
 
552 aa  99.4  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  27.41 
 
 
594 aa  99  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1565  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.98 
 
 
600 aa  98.6  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  27.41 
 
 
594 aa  99  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  27.41 
 
 
594 aa  99  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  27.41 
 
 
594 aa  98.6  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  27.41 
 
 
594 aa  99  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  27.41 
 
 
594 aa  99  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  27.41 
 
 
594 aa  99  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  26.83 
 
 
734 aa  97.8  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  27.86 
 
 
577 aa  97.8  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0866  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.81 
 
 
562 aa  97.4  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.07417  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2054  peptidoglycan synthetase FtsI  27.95 
 
 
695 aa  97.4  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.19 
 
 
614 aa  97.4  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  26.76 
 
 
622 aa  97.4  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  26.88 
 
 
568 aa  97.1  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  27.3 
 
 
580 aa  97.4  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  28.43 
 
 
575 aa  96.7  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  28.28 
 
 
670 aa  96.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  26.1 
 
 
607 aa  96.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2378  peptidoglycan glycosyltransferase  27.38 
 
 
695 aa  97.1  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.574377 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3554  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.53 
 
 
569 aa  96.3  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  28.49 
 
 
638 aa  96.3  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  26.14 
 
 
610 aa  96.7  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  26.01 
 
 
578 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  26.02 
 
 
583 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  27.22 
 
 
575 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  27.33 
 
 
713 aa  96.3  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3810  peptidoglycan glycosyltransferase  27.25 
 
 
582 aa  95.9  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  25 
 
 
614 aa  95.1  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>