More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0669 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  59.13 
 
 		 708 aa  843    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  100 
 
 		 713 aa  1456    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  49.03 
 
 		 711 aa  671    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  47.41 
 
 		 705 aa  653    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  59.94 
 
 		 740 aa  869    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  61.04 
 
 		 708 aa  879    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  45.97 
 
 		 695 aa  627  1e-178  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  44.92 
 
 		 682 aa  558  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  43.93 
 
 		 644 aa  549  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  43.4 
 
 		 646 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.89 
 
 		 704 aa  539  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  46.99 
 
 		 649 aa  538  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  43.51 
 
 		 645 aa  507  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  39.97 
 
 		 723 aa  500  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  41.47 
 
 		 638 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  41.47 
 
 		 638 aa  496  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  41.47 
 
 		 638 aa  496  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  41.47 
 
 		 638 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3968  sporulation specific penicillin-binding protein  41.47 
 
 		 638 aa  497  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313702  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4016  sporulation specific penicillin-binding protein  41.47 
 
 		 638 aa  496  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.622695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1225  sporulation specific penicillin-binding protein  41.47 
 
 		 638 aa  496  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00126151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3742  stage V sporulation protein D  41.78 
 
 		 638 aa  496  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3961  sporulation specific penicillin-binding protein  41.31 
 
 		 638 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3930  sporulation specific penicillin-binding protein  41.47 
 
 		 638 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892193 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  41 
 
 		 638 aa  489  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  38.68 
 
 		 719 aa  481  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  37.22 
 
 		 734 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2476  peptidoglycan glycosyltransferase  37.67 
 
 		 649 aa  445  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  35.26 
 
 		 721 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  43.84 
 
 		 553 aa  438  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  35.12 
 
 		 728 aa  439  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  36.6 
 
 		 657 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.39 
 
 		 672 aa  414  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.41 
 
 		 662 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  33.43 
 
 		 727 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1846  stage V sporulation protein D  34.16 
 
 		 727 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1831  stage V sporulation protein D  33.11 
 
 		 739 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.25 
 
 		 654 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.66 
 
 		 657 aa  389  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2117  stage V sporulation protein D  32.44 
 
 		 739 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  36.64 
 
 		 660 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  36.83 
 
 		 657 aa  385  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  34.24 
 
 		 729 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  34.71 
 
 		 657 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.78 
 
 		 582 aa  378  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  33.38 
 
 		 656 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1014  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.9 
 
 		 737 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2566  peptidoglycan glycosyltransferase  35.14 
 
 		 717 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1886  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.02 
 
 		 736 aa  360  6e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  35.03 
 
 		 586 aa  347  4e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2634  penicillin-binding protein  33.93 
 
 		 712 aa  346  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000396671 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2677  penicillin-binding protein  33.7 
 
 		 712 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3962  penicillin-binding protein  34.56 
 
 		 716 aa  343  8e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3969  penicillin-binding protein  33.99 
 
 		 699 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00715296  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.87 
 
 		 680 aa  340  4e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1271  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.28 
 
 		 730 aa  340  5e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0816576  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2431  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  33.52 
 
 		 712 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00172457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3743  peptidoglycan glycosyltransferase  34.56 
 
 		 699 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3767  penicillin-binding protein  33.85 
 
 		 716 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4055  penicillin-binding protein  33.85 
 
 		 716 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2666  penicillin-binding protein  33.24 
 
 		 712 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000149104 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3931  penicillin-binding protein  33.57 
 
 		 699 aa  336  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0456911 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2488  peptidoglycan glycosyltransferase  32.73 
 
 		 712 aa  334  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00738321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2467  penicillin-binding protein  32.96 
 
 		 712 aa  334  3e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00794581  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3675  penicillin-binding protein  34.12 
 
 		 716 aa  334  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2648  penicillin-binding protein  32.96 
 
 		 712 aa  334  3e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3658  penicillin-binding protein  34.12 
 
 		 716 aa  333  5e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2679  penicillin-binding protein  33.1 
 
 		 712 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2717  penicillin-binding protein  33.24 
 
 		 712 aa  332  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211599  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2392  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  32.96 
 
 		 712 aa  331  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311388  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4017  penicillin-binding protein  33.97 
 
 		 716 aa  330  4e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1224  penicillin-binding protein  33.93 
 
 		 699 aa  331  4e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0433521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.71 
 
 		 689 aa  324  3e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  36.03 
 
 		 631 aa  324  3e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3905  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.03 
 
 		 675 aa  321  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.17 
 
 		 553 aa  320  7e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.03 
 
 		 675 aa  319  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0866  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.18 
 
 		 562 aa  318  2e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.07417  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.05 
 
 		 670 aa  318  3e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3765  peptidoglycan glycosyltransferase  33.83 
 
 		 675 aa  318  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870412  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.64 
 
 		 645 aa  313  7.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.92 
 
 		 703 aa  312  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  34.99 
 
 		 582 aa  310  8e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.73 
 
 		 561 aa  308  2.0000000000000002e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.69 
 
 		 570 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 		 702 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.57 
 
 		 614 aa  305  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  32.81 
 
 		 622 aa  300  8e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2727  peptidoglycan glycosyltransferase  33.12 
 
 		 684 aa  300  9e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2846  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.1 
 
 		 602 aa  299  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  31.54 
 
 		 671 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  32.93 
 
 		 638 aa  298  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  32.12 
 
 		 690 aa  298  3e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2116  peptidoglycan glycosyltransferase  32.23 
 
 		 673 aa  296  8e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.54 
 
 		 654 aa  296  1e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  32.42 
 
 		 578 aa  295  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  33.39 
 
 		 553 aa  293  6e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  33.57 
 
 		 727 aa  292  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  32.62 
 
 		 578 aa  292  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.57 
 
 		 710 aa  291  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>