More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1036 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
675 aa  1355    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  55.5 
 
 
654 aa  702    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  52.21 
 
 
690 aa  681    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.73 
 
 
710 aa  632  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.14 
 
 
644 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.17 
 
 
645 aa  554  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  39.35 
 
 
656 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  37.62 
 
 
657 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  39.62 
 
 
586 aa  403  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.85 
 
 
662 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.93 
 
 
654 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.12 
 
 
657 aa  396  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  39.07 
 
 
660 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  36.63 
 
 
657 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  37.09 
 
 
657 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  35.74 
 
 
631 aa  353  5e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.45 
 
 
703 aa  352  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.73 
 
 
708 aa  338  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  36.77 
 
 
582 aa  331  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  36.4 
 
 
577 aa  323  7e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  35.27 
 
 
618 aa  323  7e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  35.44 
 
 
632 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  35.44 
 
 
632 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  35.44 
 
 
632 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  35.99 
 
 
578 aa  321  3e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  34.32 
 
 
586 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  35.47 
 
 
578 aa  320  5e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  34.35 
 
 
705 aa  320  6e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  37.25 
 
 
595 aa  318  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  36.06 
 
 
578 aa  318  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  34.91 
 
 
630 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  31.9 
 
 
719 aa  317  5e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  35.04 
 
 
578 aa  316  8e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.08 
 
 
570 aa  316  8e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  34.97 
 
 
630 aa  316  8e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  37.25 
 
 
594 aa  316  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  35.48 
 
 
614 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.25 
 
 
594 aa  316  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  34.98 
 
 
582 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  34.64 
 
 
578 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  35.48 
 
 
614 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  35.48 
 
 
614 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  35.48 
 
 
614 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  35.48 
 
 
614 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  35.48 
 
 
614 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  35.12 
 
 
580 aa  315  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  35.48 
 
 
614 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  36.09 
 
 
615 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.98 
 
 
582 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  36.09 
 
 
615 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  36.22 
 
 
570 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  35.86 
 
 
615 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  34.06 
 
 
631 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  36.79 
 
 
578 aa  314  3.9999999999999997e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  35.91 
 
 
615 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  35.29 
 
 
577 aa  313  4.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  35.11 
 
 
578 aa  313  4.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  36.68 
 
 
624 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  35.66 
 
 
614 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  36.51 
 
 
615 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  35.5 
 
 
578 aa  313  9e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  35.73 
 
 
616 aa  312  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  36.4 
 
 
615 aa  312  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  34.97 
 
 
614 aa  311  2.9999999999999997e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  33.02 
 
 
695 aa  311  2.9999999999999997e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  35.22 
 
 
580 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  34.06 
 
 
583 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.2 
 
 
621 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.16 
 
 
595 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  34.85 
 
 
649 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  36.2 
 
 
621 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  33.89 
 
 
585 aa  308  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  34.28 
 
 
594 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  34.28 
 
 
594 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  34.28 
 
 
594 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  34.28 
 
 
594 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  34.28 
 
 
594 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  34.59 
 
 
594 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  35.1 
 
 
581 aa  307  5.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.16 
 
 
595 aa  306  7e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  34.41 
 
 
594 aa  306  7e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  35.1 
 
 
582 aa  305  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  34.13 
 
 
596 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0562  peptidoglycan glycosyltransferase  32.3 
 
 
577 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.445743  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  35.44 
 
 
607 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.51 
 
 
588 aa  303  6.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.08 
 
 
680 aa  303  6.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  35.63 
 
 
553 aa  302  1e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.14 
 
 
670 aa  302  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  37.52 
 
 
605 aa  302  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.08 
 
 
614 aa  301  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  35.06 
 
 
729 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  36 
 
 
653 aa  301  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  34.5 
 
 
708 aa  301  3e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.93 
 
 
692 aa  300  4e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  35.26 
 
 
613 aa  300  4e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  36.21 
 
 
600 aa  300  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  34.55 
 
 
711 aa  300  7e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.37 
 
 
582 aa  300  8e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  35.67 
 
 
622 aa  299  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>