More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0478 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  56.24 
 
 
723 aa  860    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 
734 aa  1496    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  41.9 
 
 
719 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  39.67 
 
 
711 aa  510  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  43.8 
 
 
649 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  38.36 
 
 
695 aa  479  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  37.22 
 
 
713 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  39.32 
 
 
708 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  36.1 
 
 
740 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  38.4 
 
 
682 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  36.59 
 
 
705 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  35.96 
 
 
708 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  36.62 
 
 
721 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.78 
 
 
704 aa  424  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2476  peptidoglycan glycosyltransferase  38.1 
 
 
649 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  35.63 
 
 
728 aa  415  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  35.01 
 
 
727 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  37.8 
 
 
644 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  38.4 
 
 
646 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1846  stage V sporulation protein D  34.61 
 
 
727 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1831  stage V sporulation protein D  34.97 
 
 
739 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2117  stage V sporulation protein D  34.98 
 
 
739 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  39.25 
 
 
553 aa  379  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3961  sporulation specific penicillin-binding protein  36.78 
 
 
638 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  36.78 
 
 
638 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  36.78 
 
 
638 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  36.78 
 
 
638 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3742  stage V sporulation protein D  37.22 
 
 
638 aa  375  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  36.78 
 
 
638 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4016  sporulation specific penicillin-binding protein  36.71 
 
 
638 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.622695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  36.92 
 
 
638 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3968  sporulation specific penicillin-binding protein  36.78 
 
 
638 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3930  sporulation specific penicillin-binding protein  36.78 
 
 
638 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892193 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1225  sporulation specific penicillin-binding protein  36.56 
 
 
638 aa  372  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00126151  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  35.01 
 
 
645 aa  356  8.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  32.45 
 
 
657 aa  345  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.79 
 
 
582 aa  344  4e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.49 
 
 
657 aa  341  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  34.99 
 
 
656 aa  320  5e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.69 
 
 
662 aa  312  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2477  peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 
651 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.686042  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  30.04 
 
 
729 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.88 
 
 
672 aa  302  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.15 
 
 
654 aa  297  6e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1014  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.24 
 
 
737 aa  292  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2634  penicillin-binding protein  31.94 
 
 
712 aa  290  8e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000396671 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  29.89 
 
 
657 aa  288  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2679  penicillin-binding protein  31.54 
 
 
712 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2717  penicillin-binding protein  31.54 
 
 
712 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211599  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  30.38 
 
 
660 aa  288  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2488  peptidoglycan glycosyltransferase  31.17 
 
 
712 aa  287  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00738321  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  33.67 
 
 
586 aa  286  8e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2677  penicillin-binding protein  31.81 
 
 
712 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1886  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.68 
 
 
736 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2431  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  31.27 
 
 
712 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00172457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2666  penicillin-binding protein  30.81 
 
 
712 aa  281  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000149104 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2467  penicillin-binding protein  31.27 
 
 
712 aa  280  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00794581  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2648  penicillin-binding protein  31.27 
 
 
712 aa  280  5e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.37 
 
 
689 aa  280  6e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2566  peptidoglycan glycosyltransferase  31.43 
 
 
717 aa  279  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2392  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  30.54 
 
 
712 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311388  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3962  penicillin-binding protein  30.42 
 
 
716 aa  274  6e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  32.62 
 
 
631 aa  272  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3743  peptidoglycan glycosyltransferase  30.42 
 
 
699 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41017  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  30.84 
 
 
657 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3969  penicillin-binding protein  30.42 
 
 
699 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00715296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3767  penicillin-binding protein  30.18 
 
 
716 aa  271  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4055  penicillin-binding protein  30.18 
 
 
716 aa  271  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.76 
 
 
645 aa  270  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3931  penicillin-binding protein  29.9 
 
 
699 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0456911 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3675  penicillin-binding protein  30.18 
 
 
716 aa  268  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3658  penicillin-binding protein  30.18 
 
 
716 aa  266  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1224  penicillin-binding protein  30.42 
 
 
699 aa  265  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0433521  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4017  penicillin-binding protein  30.52 
 
 
716 aa  263  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  31.54 
 
 
638 aa  262  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2727  peptidoglycan glycosyltransferase  31.3 
 
 
684 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2899  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.79 
 
 
680 aa  259  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0113727  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.44 
 
 
675 aa  258  3e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3905  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.58 
 
 
675 aa  258  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  29.28 
 
 
690 aa  257  7e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3765  peptidoglycan glycosyltransferase  26.84 
 
 
675 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.56 
 
 
703 aa  254  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4620  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.25 
 
 
609 aa  254  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.16 
 
 
670 aa  253  9.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 
553 aa  252  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  27.91 
 
 
675 aa  252  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.37 
 
 
702 aa  250  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3955  peptidoglycan glycosyltransferase  31.31 
 
 
603 aa  250  7e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.194154  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2508  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.03 
 
 
673 aa  250  8e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.53 
 
 
654 aa  249  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  29.53 
 
 
653 aa  249  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  31.24 
 
 
670 aa  248  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  29.38 
 
 
671 aa  248  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  29.73 
 
 
613 aa  247  6e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0049  penicillin-binding protein 3  31.99 
 
 
663 aa  246  8e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0588264  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  29.83 
 
 
613 aa  246  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.21 
 
 
612 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1199  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.21 
 
 
612 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0480  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.43 
 
 
574 aa  245  1.9999999999999999e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.17 
 
 
708 aa  245  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0523217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>