More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2477 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2477  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
651 aa  1345    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.686042  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2476  peptidoglycan glycosyltransferase  37.04 
 
 
649 aa  359  7e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  34.31 
 
 
723 aa  319  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  32.54 
 
 
719 aa  313  6.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  33.22 
 
 
734 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3742  stage V sporulation protein D  35.34 
 
 
638 aa  308  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4016  sporulation specific penicillin-binding protein  34.95 
 
 
638 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.622695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  34.95 
 
 
638 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  34.95 
 
 
638 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  34.95 
 
 
638 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  34.95 
 
 
638 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1225  sporulation specific penicillin-binding protein  34.95 
 
 
638 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00126151  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3961  sporulation specific penicillin-binding protein  34.84 
 
 
638 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3968  sporulation specific penicillin-binding protein  34.95 
 
 
638 aa  303  9e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313702  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  34.56 
 
 
649 aa  301  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3930  sporulation specific penicillin-binding protein  34.78 
 
 
638 aa  299  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892193 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  34.83 
 
 
638 aa  297  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1831  stage V sporulation protein D  33.71 
 
 
739 aa  294  3e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2117  stage V sporulation protein D  35.14 
 
 
739 aa  287  4e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  33.05 
 
 
711 aa  287  5e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  32.26 
 
 
727 aa  287  5e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  34.44 
 
 
646 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  33.73 
 
 
644 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  32.48 
 
 
695 aa  282  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1846  stage V sporulation protein D  32.04 
 
 
727 aa  283  1e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.25 
 
 
704 aa  280  5e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  31.48 
 
 
657 aa  276  9e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  31.75 
 
 
682 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  32.38 
 
 
553 aa  270  7e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  33.72 
 
 
721 aa  269  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  32.82 
 
 
645 aa  267  5e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  33.39 
 
 
728 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.05 
 
 
672 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  33.15 
 
 
708 aa  261  4e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  32.4 
 
 
631 aa  258  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  31.88 
 
 
656 aa  257  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  30.63 
 
 
657 aa  256  8e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  32.84 
 
 
705 aa  255  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.48 
 
 
657 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.32 
 
 
662 aa  253  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  29.97 
 
 
713 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  30.66 
 
 
740 aa  241  4e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  30.41 
 
 
729 aa  240  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.83 
 
 
582 aa  234  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.03 
 
 
654 aa  234  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  31.69 
 
 
657 aa  234  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1886  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.15 
 
 
736 aa  230  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  30.31 
 
 
660 aa  229  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.61 
 
 
561 aa  225  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.62 
 
 
581 aa  224  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  29.62 
 
 
675 aa  224  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  31.47 
 
 
586 aa  223  7e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  28.64 
 
 
638 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.25 
 
 
689 aa  218  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1014  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.59 
 
 
737 aa  217  7e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  30.17 
 
 
653 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.62 
 
 
703 aa  216  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4620  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.56 
 
 
609 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1853  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.29 
 
 
624 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2508  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.35 
 
 
673 aa  214  5.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  28.71 
 
 
618 aa  213  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  28.69 
 
 
578 aa  212  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  28.66 
 
 
635 aa  211  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2727  peptidoglycan glycosyltransferase  31.27 
 
 
684 aa  211  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1271  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.03 
 
 
730 aa  210  6e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0816576  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.5 
 
 
607 aa  210  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.87 
 
 
644 aa  210  7e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.05 
 
 
645 aa  209  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  28.33 
 
 
578 aa  208  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  29.21 
 
 
583 aa  208  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.2 
 
 
619 aa  208  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  27.92 
 
 
587 aa  207  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  29.14 
 
 
581 aa  207  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  29.67 
 
 
670 aa  207  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  28.93 
 
 
583 aa  207  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  29.88 
 
 
548 aa  207  6e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2566  peptidoglycan glycosyltransferase  29.6 
 
 
717 aa  207  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  28.71 
 
 
632 aa  207  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  28.71 
 
 
632 aa  207  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.14 
 
 
570 aa  207  6e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  28.71 
 
 
632 aa  207  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24950  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  28.23 
 
 
637 aa  206  8e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439069  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  29.83 
 
 
552 aa  206  9e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  28.93 
 
 
583 aa  206  9e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  28.93 
 
 
583 aa  206  9e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  29.04 
 
 
583 aa  206  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  28.55 
 
 
578 aa  206  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1498  peptidoglycan glycosyltransferase  27.8 
 
 
556 aa  206  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00439152  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  28.5 
 
 
584 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  28.34 
 
 
584 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.34 
 
 
584 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  27.57 
 
 
578 aa  206  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.81 
 
 
655 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  28.34 
 
 
584 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3955  peptidoglycan glycosyltransferase  26.04 
 
 
603 aa  206  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.194154  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3529  peptidoglycan glycosyltransferase  28.5 
 
 
652 aa  205  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0960605  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  29.08 
 
 
601 aa  204  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.38 
 
 
553 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.21 
 
 
595 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2628  peptidoglycan glycosyltransferase  26.67 
 
 
655 aa  204  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>