More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0480 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0480  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
574 aa  1177    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09550  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  37.48 
 
 
581 aa  353  4e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.102088 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08800  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  38.97 
 
 
557 aa  332  1e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000196168 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2101  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.18 
 
 
633 aa  289  9e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277912 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  34.44 
 
 
711 aa  286  5.999999999999999e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  34.62 
 
 
708 aa  278  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.99 
 
 
553 aa  273  5.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  32.85 
 
 
695 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.8 
 
 
582 aa  269  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24950  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33 
 
 
637 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439069  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  33.27 
 
 
638 aa  265  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  32.68 
 
 
657 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  32.32 
 
 
729 aa  258  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  31.73 
 
 
734 aa  256  9e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  31.96 
 
 
713 aa  253  7e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.09 
 
 
692 aa  253  8.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.32 
 
 
657 aa  252  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  31.99 
 
 
656 aa  251  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  31.36 
 
 
670 aa  249  8e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  31.13 
 
 
675 aa  249  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  31.73 
 
 
657 aa  249  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.65 
 
 
662 aa  249  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.1 
 
 
607 aa  248  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  32.3 
 
 
705 aa  244  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  32.5 
 
 
723 aa  242  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  31.82 
 
 
727 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 
839 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  32.27 
 
 
740 aa  239  6.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  31.34 
 
 
719 aa  237  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3023  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.79 
 
 
634 aa  236  8e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0205906  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.16 
 
 
581 aa  236  9e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.74 
 
 
654 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  31.42 
 
 
553 aa  234  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  30.42 
 
 
653 aa  233  8.000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  29.83 
 
 
635 aa  232  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.09 
 
 
635 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22860  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.5 
 
 
754 aa  231  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  31.63 
 
 
646 aa  230  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.94 
 
 
644 aa  230  5e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  29.93 
 
 
631 aa  230  5e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12193  penicillin-binding membrane protein pbpB  30.07 
 
 
679 aa  230  6e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.98253e-20  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.64 
 
 
570 aa  229  7e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.42 
 
 
704 aa  229  7e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  31.14 
 
 
577 aa  228  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3529  peptidoglycan glycosyltransferase  29.52 
 
 
652 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0960605  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  31.87 
 
 
660 aa  228  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1254  peptidoglycan glycosyltransferase  29.91 
 
 
562 aa  228  3e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  31.69 
 
 
645 aa  227  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1068  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.19 
 
 
579 aa  227  4e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  31.01 
 
 
644 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3444  peptidoglycan glycosyltransferase  33.15 
 
 
716 aa  227  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00730132  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.37 
 
 
672 aa  226  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3218  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.47 
 
 
716 aa  226  7e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0525983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.52 
 
 
583 aa  226  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  31.03 
 
 
624 aa  226  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.29 
 
 
710 aa  225  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  29.35 
 
 
690 aa  225  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.62 
 
 
680 aa  224  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  31.48 
 
 
708 aa  224  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2476  peptidoglycan glycosyltransferase  28.79 
 
 
649 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  31.58 
 
 
618 aa  223  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  29.96 
 
 
682 aa  223  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  31.08 
 
 
657 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  29.93 
 
 
638 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  29.93 
 
 
638 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  29.93 
 
 
638 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  29.93 
 
 
638 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  30.74 
 
 
630 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3961  sporulation specific penicillin-binding protein  29.93 
 
 
638 aa  221  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3968  sporulation specific penicillin-binding protein  29.93 
 
 
638 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313702  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4016  sporulation specific penicillin-binding protein  29.93 
 
 
638 aa  221  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.622695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3742  stage V sporulation protein D  29.93 
 
 
638 aa  221  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1225  sporulation specific penicillin-binding protein  29.93 
 
 
638 aa  221  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00126151  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.24 
 
 
645 aa  220  6e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  29.73 
 
 
615 aa  220  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  28.93 
 
 
613 aa  219  7.999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  30.57 
 
 
630 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  31.58 
 
 
632 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  31.58 
 
 
632 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  29.41 
 
 
613 aa  219  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  31.58 
 
 
632 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  28.65 
 
 
622 aa  218  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.93 
 
 
654 aa  218  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.84 
 
 
655 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3930  sporulation specific penicillin-binding protein  29.93 
 
 
638 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892193 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  30.3 
 
 
586 aa  217  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.91 
 
 
621 aa  217  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.06 
 
 
614 aa  217  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  30.14 
 
 
616 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  30.23 
 
 
728 aa  216  8e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  29.71 
 
 
582 aa  216  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  29.8 
 
 
727 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1278  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.65 
 
 
618 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.907115  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  29.38 
 
 
615 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  28.24 
 
 
614 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  28.32 
 
 
614 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  29.73 
 
 
621 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  28.24 
 
 
614 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  28.24 
 
 
614 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3324  peptidoglycan glycosyltransferase  28.21 
 
 
642 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0881195  normal  0.041689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>