More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2793 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 586 aa  1199    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.71 
 
 		 654 aa  496  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  46.55 
 
 		 660 aa  479  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  44.6 
 
 		 657 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  43.45 
 
 		 656 aa  458  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  43.96 
 
 		 657 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  43.08 
 
 		 657 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  43.14 
 
 		 657 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.53 
 
 		 662 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  39.62 
 
 		 675 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  37.57 
 
 		 690 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.97 
 
 		 654 aa  385  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.44 
 
 		 703 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.55 
 
 		 645 aa  373  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  38.61 
 
 		 711 aa  371  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  38.5 
 
 		 705 aa  362  7.0000000000000005e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  36.68 
 
 		 695 aa  359  6e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  37.45 
 
 		 708 aa  360  6e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.52 
 
 		 710 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  37.91 
 
 		 671 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.31 
 
 		 675 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.07 
 
 		 644 aa  351  2e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.35 
 
 		 570 aa  350  6e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  35.03 
 
 		 713 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  34.68 
 
 		 631 aa  346  7e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3905  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.62 
 
 		 675 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3765  peptidoglycan glycosyltransferase  39.62 
 
 		 675 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870412  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  37.1 
 
 		 740 aa  344  2e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  37.77 
 
 		 582 aa  343  5.999999999999999e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.65 
 
 		 588 aa  338  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.24 
 
 		 708 aa  338  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  33.67 
 
 		 719 aa  332  8e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.93 
 
 		 582 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  36.78 
 
 		 577 aa  327  5e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  37.72 
 
 		 644 aa  326  6e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  36.93 
 
 		 682 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  33.09 
 
 		 594 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  34.59 
 
 		 729 aa  325  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 		 632 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 		 632 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 		 632 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  32.91 
 
 		 594 aa  324  4e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  32.91 
 
 		 594 aa  324  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  32.91 
 
 		 594 aa  324  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  32.91 
 
 		 594 aa  324  4e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  32.91 
 
 		 594 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  32.91 
 
 		 594 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.8 
 
 		 680 aa  323  7e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  32.79 
 
 		 596 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.7 
 
 		 577 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  33.33 
 
 		 577 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  37.34 
 
 		 839 aa  320  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  32.97 
 
 		 618 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.61 
 
 		 561 aa  318  2e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  36.2 
 
 		 670 aa  318  2e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.84 
 
 		 571 aa  317  3e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  32.91 
 
 		 630 aa  317  6e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  35.13 
 
 		 570 aa  316  7e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  35.82 
 
 		 646 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  32.73 
 
 		 630 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  35.68 
 
 		 595 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  34.2 
 
 		 583 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  32.43 
 
 		 631 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  35.28 
 
 		 638 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  34.9 
 
 		 622 aa  313  6.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.73 
 
 		 595 aa  312  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  35.7 
 
 		 553 aa  312  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.73 
 
 		 595 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  33.7 
 
 		 578 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  35.16 
 
 		 587 aa  310  6.999999999999999e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.94 
 
 		 553 aa  308  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  35.32 
 
 		 594 aa  309  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.32 
 
 		 594 aa  309  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 614 aa  308  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  35.94 
 
 		 597 aa  306  9.000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  35.18 
 
 		 613 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  35.18 
 
 		 613 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.7 
 
 		 670 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  36.13 
 
 		 727 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  37.19 
 
 		 649 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  35.61 
 
 		 552 aa  305  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 		 578 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  35.2 
 
 		 601 aa  304  3.0000000000000004e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  35.61 
 
 		 548 aa  304  3.0000000000000004e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  35.56 
 
 		 605 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  34.8 
 
 		 585 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.41 
 
 		 621 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  34.03 
 
 		 578 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.16 
 
 		 702 aa  303  8.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.99 
 
 		 704 aa  302  9e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  32.44 
 
 		 587 aa  302  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  32.67 
 
 		 607 aa  302  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  35.14 
 
 		 615 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  34.23 
 
 		 621 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  34.77 
 
 		 615 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  34.27 
 
 		 575 aa  300  3e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  34.77 
 
 		 615 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  34.3 
 
 		 624 aa  301  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  34.77 
 
 		 615 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  34.77 
 
 		 615 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>