More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2238 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  80.28 
 
 		 578 aa  957    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  77.39 
 
 		 594 aa  922    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  77.39 
 
 		 594 aa  922    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  75.48 
 
 		 630 aa  897    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  77.39 
 
 		 594 aa  922    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  77.57 
 
 		 594 aa  924    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  75.65 
 
 		 631 aa  904    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  77.57 
 
 		 594 aa  924    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  76.7 
 
 		 596 aa  914    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  75.83 
 
 		 632 aa  906    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  100 
 
 		 577 aa  1168    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  75.83 
 
 		 632 aa  906    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  77.39 
 
 		 594 aa  922    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  76 
 
 		 618 aa  907    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  95.49 
 
 		 577 aa  1124    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  75.65 
 
 		 630 aa  899    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  75.83 
 
 		 632 aa  906    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  77.39 
 
 		 594 aa  922    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  51.96 
 
 		 581 aa  593  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  51.25 
 
 		 582 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  51.25 
 
 		 582 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  51.16 
 
 		 600 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  50.9 
 
 		 577 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  49.39 
 
 		 624 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  49.82 
 
 		 582 aa  570  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.36 
 
 		 582 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  51.43 
 
 		 580 aa  571  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  50.54 
 
 		 578 aa  568  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  48 
 
 		 614 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.7 
 
 		 621 aa  559  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  48.49 
 
 		 614 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  48.49 
 
 		 614 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  48.49 
 
 		 614 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  48.49 
 
 		 614 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  48.49 
 
 		 614 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  48.49 
 
 		 614 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  48.49 
 
 		 614 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  49.28 
 
 		 582 aa  555  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.45 
 
 		 595 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.09 
 
 		 595 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  48.7 
 
 		 621 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  51.16 
 
 		 605 aa  555  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  49.37 
 
 		 614 aa  555  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  48.27 
 
 		 616 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  49.55 
 
 		 595 aa  552  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  49.19 
 
 		 615 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  48.12 
 
 		 615 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  49.19 
 
 		 607 aa  545  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  47.94 
 
 		 615 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  48.12 
 
 		 615 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  48.12 
 
 		 615 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  48.48 
 
 		 615 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  49.37 
 
 		 580 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.77 
 
 		 588 aa  512  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  47.86 
 
 		 583 aa  502  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.31 
 
 		 590 aa  498  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  47.31 
 
 		 590 aa  494  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0343  penicillin-binding protein  48.04 
 
 		 570 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.503077  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1244  penicillin-binding protein  48.04 
 
 		 570 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.313852  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1082  penicillin-binding protein  48.04 
 
 		 570 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.443552  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0239  penicillin-binding protein  48.48 
 
 		 615 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229072  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1661  penicillin-binding protein  48.48 
 
 		 570 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1750  penicillin-binding protein  47.86 
 
 		 570 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.25987  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.44 
 
 		 570 aa  474  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  44.31 
 
 		 577 aa  457  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  43.97 
 
 		 587 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  43.43 
 
 		 570 aa  432  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  42 
 
 		 571 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  42.62 
 
 		 548 aa  426  1e-118  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  42.62 
 
 		 552 aa  426  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  41 
 
 		 587 aa  425  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  42.23 
 
 		 575 aa  419  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  42.32 
 
 		 570 aa  419  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  41.68 
 
 		 613 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  39.86 
 
 		 583 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  40.53 
 
 		 613 aa  414  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  39.14 
 
 		 583 aa  413  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3810  peptidoglycan glycosyltransferase  40.53 
 
 		 582 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  38.78 
 
 		 583 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  38.6 
 
 		 583 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  38.78 
 
 		 583 aa  411  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  39.14 
 
 		 578 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  38.78 
 
 		 584 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.78 
 
 		 584 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  38.78 
 
 		 584 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  38.65 
 
 		 581 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  38.78 
 
 		 584 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  40.33 
 
 		 578 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  39.9 
 
 		 610 aa  408  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  39.28 
 
 		 553 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  37.46 
 
 		 586 aa  403  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  40.93 
 
 		 622 aa  405  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0076  penicillin-binding protein  48.6 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  39.1 
 
 		 553 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  41.52 
 
 		 578 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  39.46 
 
 		 580 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  39.68 
 
 		 579 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  38.24 
 
 		 578 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  39.86 
 
 		 579 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  37.52 
 
 		 578 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>