More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6002 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  76.52 
 
 
632 aa  908    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  76.87 
 
 
594 aa  916    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  76.87 
 
 
594 aa  916    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  77.04 
 
 
594 aa  917    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  76.87 
 
 
594 aa  916    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  80.83 
 
 
578 aa  960    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
577 aa  1169    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  77.04 
 
 
594 aa  918    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  76.87 
 
 
618 aa  910    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  76.35 
 
 
631 aa  909    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  76.52 
 
 
596 aa  910    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  95.49 
 
 
577 aa  1124    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  76.52 
 
 
632 aa  908    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  76.87 
 
 
594 aa  916    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  76.87 
 
 
594 aa  916    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  76.52 
 
 
630 aa  907    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  76.17 
 
 
630 aa  904    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  76.52 
 
 
632 aa  908    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  52.23 
 
 
581 aa  596  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  51.52 
 
 
582 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  51.52 
 
 
582 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  50.99 
 
 
577 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.45 
 
 
582 aa  573  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  51.52 
 
 
580 aa  570  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  49.91 
 
 
582 aa  571  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  50.27 
 
 
578 aa  566  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  50.36 
 
 
600 aa  567  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  48.7 
 
 
624 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.36 
 
 
595 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  50.18 
 
 
614 aa  563  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  47.83 
 
 
614 aa  558  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.82 
 
 
595 aa  559  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  48.75 
 
 
614 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  49.46 
 
 
595 aa  556  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  48.75 
 
 
614 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  49.55 
 
 
582 aa  555  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  48.75 
 
 
614 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  48.75 
 
 
614 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  48.75 
 
 
614 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  48.75 
 
 
614 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  48.75 
 
 
614 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  48 
 
 
621 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  48.1 
 
 
616 aa  555  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  51.25 
 
 
605 aa  554  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  48.21 
 
 
615 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  48 
 
 
621 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  48.21 
 
 
615 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  48.21 
 
 
615 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  48.39 
 
 
615 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  48.04 
 
 
615 aa  545  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  49.46 
 
 
580 aa  543  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  49.28 
 
 
607 aa  543  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  48.21 
 
 
615 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.93 
 
 
588 aa  525  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  47.53 
 
 
583 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.27 
 
 
590 aa  499  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  47.8 
 
 
590 aa  496  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1750  penicillin-binding protein  47.33 
 
 
570 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.25987  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1244  penicillin-binding protein  47.51 
 
 
570 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.313852  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1082  penicillin-binding protein  47.51 
 
 
570 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.443552  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0239  penicillin-binding protein  47.96 
 
 
615 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229072  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1661  penicillin-binding protein  47.96 
 
 
570 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0343  penicillin-binding protein  47.51 
 
 
570 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.503077  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.26 
 
 
570 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  44.74 
 
 
577 aa  458  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  44.07 
 
 
587 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.13 
 
 
571 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  43.61 
 
 
570 aa  430  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  43.13 
 
 
570 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  42.99 
 
 
548 aa  427  1e-118  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  42.99 
 
 
552 aa  427  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  41 
 
 
587 aa  428  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  43.14 
 
 
575 aa  422  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  40.57 
 
 
583 aa  421  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  40.22 
 
 
583 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  41.85 
 
 
613 aa  412  1e-114  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  39.5 
 
 
583 aa  415  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  39.32 
 
 
583 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  39.5 
 
 
583 aa  415  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  39.5 
 
 
584 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.5 
 
 
584 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  39.5 
 
 
584 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  40.7 
 
 
613 aa  410  1e-113  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  40.33 
 
 
578 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  39.32 
 
 
578 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  40.93 
 
 
622 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  39.5 
 
 
584 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3810  peptidoglycan glycosyltransferase  40.54 
 
 
582 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  39.79 
 
 
610 aa  408  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  39.57 
 
 
580 aa  402  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  39.75 
 
 
553 aa  402  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  38.88 
 
 
581 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  38.34 
 
 
586 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  39.38 
 
 
553 aa  398  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  41.2 
 
 
578 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  38.57 
 
 
578 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  38.24 
 
 
578 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  39.14 
 
 
601 aa  393  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  38.7 
 
 
568 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  39.53 
 
 
579 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>