More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1464 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  62.15 
 
 
614 aa  746    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  84.43 
 
 
582 aa  1020    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  56.6 
 
 
595 aa  653    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  54.43 
 
 
621 aa  641    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  55.21 
 
 
614 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  55.21 
 
 
614 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  57.37 
 
 
600 aa  673    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  65.17 
 
 
607 aa  775    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  55.21 
 
 
614 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  55.13 
 
 
616 aa  639    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
582 aa  1186    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  54.69 
 
 
614 aa  637    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  73.02 
 
 
580 aa  876    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  74.78 
 
 
577 aa  901    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  54.43 
 
 
621 aa  643    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  56.57 
 
 
605 aa  656    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  75.26 
 
 
578 aa  898    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  78.45 
 
 
580 aa  955    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  84.26 
 
 
582 aa  1019    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  55.21 
 
 
614 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  75.22 
 
 
582 aa  902    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  55.21 
 
 
614 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  55.21 
 
 
614 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  55.9 
 
 
624 aa  653    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  55.21 
 
 
614 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  84.11 
 
 
581 aa  1018    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  55.56 
 
 
595 aa  633  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  54.26 
 
 
615 aa  634  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  55.73 
 
 
595 aa  634  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  54.78 
 
 
615 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  54.96 
 
 
615 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  53.37 
 
 
615 aa  631  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  53.37 
 
 
615 aa  631  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  53.57 
 
 
615 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  52.44 
 
 
588 aa  596  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  52.11 
 
 
582 aa  592  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  50.88 
 
 
596 aa  592  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  50.88 
 
 
594 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  51.05 
 
 
594 aa  591  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  50.88 
 
 
594 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  50.88 
 
 
594 aa  591  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  50.88 
 
 
594 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  51.85 
 
 
632 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  51.85 
 
 
632 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  50.88 
 
 
594 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  51.05 
 
 
594 aa  591  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  51.85 
 
 
630 aa  591  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  51.85 
 
 
632 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  51.41 
 
 
630 aa  588  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  51.06 
 
 
618 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  51.14 
 
 
631 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  49.82 
 
 
578 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  50.26 
 
 
583 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  49.82 
 
 
577 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.91 
 
 
577 aa  571  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.17 
 
 
590 aa  561  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  50.69 
 
 
590 aa  561  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  49.07 
 
 
587 aa  518  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.24 
 
 
570 aa  484  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  45.26 
 
 
548 aa  472  1e-132  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  45.26 
 
 
552 aa  473  1e-132  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  42.91 
 
 
575 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  43.45 
 
 
580 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  43.39 
 
 
577 aa  463  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  44.44 
 
 
570 aa  456  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.23 
 
 
571 aa  458  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  43.5 
 
 
587 aa  456  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  41.13 
 
 
613 aa  444  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  43.56 
 
 
553 aa  444  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  43.42 
 
 
570 aa  443  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  41.32 
 
 
613 aa  445  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  43.37 
 
 
553 aa  441  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  42.37 
 
 
576 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1750  penicillin-binding protein  41.89 
 
 
570 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.25987  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1661  penicillin-binding protein  41.53 
 
 
570 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  41.32 
 
 
622 aa  436  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1082  penicillin-binding protein  41.71 
 
 
570 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.443552  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0239  penicillin-binding protein  41.53 
 
 
615 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229072  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1244  penicillin-binding protein  41.71 
 
 
570 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.313852  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0343  penicillin-binding protein  41.71 
 
 
570 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.503077  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  41.38 
 
 
579 aa  438  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  42.01 
 
 
575 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  41.3 
 
 
580 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.97 
 
 
614 aa  434  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0562  peptidoglycan glycosyltransferase  39.54 
 
 
577 aa  433  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.445743  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  41.56 
 
 
568 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  40.4 
 
 
583 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  41.74 
 
 
579 aa  429  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  41.56 
 
 
579 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  40.58 
 
 
578 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  39.85 
 
 
586 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  39.71 
 
 
582 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  39.89 
 
 
582 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  39.12 
 
 
578 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  39.31 
 
 
578 aa  412  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  39.31 
 
 
575 aa  412  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  40.86 
 
 
578 aa  409  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  38.39 
 
 
578 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.57 
 
 
584 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  38.76 
 
 
583 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>