More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0842 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  100 
 
 
568 aa  1168    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  53.75 
 
 
580 aa  611  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  49.29 
 
 
579 aa  555  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  49.11 
 
 
580 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  49.28 
 
 
579 aa  551  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  49.46 
 
 
579 aa  552  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  50.91 
 
 
570 aa  543  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  47.86 
 
 
583 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  47.69 
 
 
576 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  48.94 
 
 
575 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  47.33 
 
 
578 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  47.67 
 
 
582 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  47.31 
 
 
582 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  47.69 
 
 
575 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  47.73 
 
 
587 aa  527  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  47.75 
 
 
583 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  46.81 
 
 
552 aa  491  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  46.81 
 
 
548 aa  491  1e-137  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.73 
 
 
570 aa  490  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  46.64 
 
 
575 aa  486  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.5 
 
 
584 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  44.5 
 
 
584 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  44.5 
 
 
584 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  44.5 
 
 
584 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  45.49 
 
 
578 aa  486  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  44.42 
 
 
583 aa  483  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  46.63 
 
 
570 aa  481  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  43.98 
 
 
578 aa  480  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.44 
 
 
571 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  45.16 
 
 
622 aa  478  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  43.19 
 
 
583 aa  473  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.84 
 
 
614 aa  472  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  44.26 
 
 
582 aa  473  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  47.41 
 
 
587 aa  475  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  43.54 
 
 
583 aa  475  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  43.36 
 
 
583 aa  474  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  43.54 
 
 
583 aa  475  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.4 
 
 
588 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  43.91 
 
 
613 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  42.48 
 
 
578 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  43.01 
 
 
581 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  42.09 
 
 
586 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  43.91 
 
 
613 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  41.68 
 
 
601 aa  462  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  42.58 
 
 
578 aa  463  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  41.91 
 
 
597 aa  464  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  41.95 
 
 
578 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3810  peptidoglycan glycosyltransferase  43.67 
 
 
582 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  43.74 
 
 
600 aa  458  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  41.77 
 
 
578 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  45.24 
 
 
605 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.32 
 
 
595 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  43.45 
 
 
595 aa  451  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  42.83 
 
 
577 aa  451  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  41.92 
 
 
582 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.57 
 
 
582 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  41.23 
 
 
580 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  42.34 
 
 
553 aa  448  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  42.34 
 
 
553 aa  448  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.14 
 
 
595 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  42.93 
 
 
580 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  43.47 
 
 
614 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  42.47 
 
 
581 aa  444  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  42.78 
 
 
607 aa  443  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  42.57 
 
 
580 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  40.18 
 
 
585 aa  439  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  41.98 
 
 
614 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  41.98 
 
 
614 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  41.68 
 
 
577 aa  435  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  43.22 
 
 
621 aa  438  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  41.98 
 
 
614 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  41.98 
 
 
614 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  41.98 
 
 
614 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  41.98 
 
 
614 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2968  penicillin-binding protein 3A  39.58 
 
 
565 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  41.56 
 
 
582 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2650  peptidoglycan synthetase FtsI precursor (peptidoglycan glycosyltransferase 3) (penicillin-binding protein 3)  40.83 
 
 
579 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  41.8 
 
 
614 aa  435  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35190  penicillin-binding protein 3A  39.05 
 
 
565 aa  435  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.29 
 
 
621 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  41.08 
 
 
614 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.64 
 
 
582 aa  432  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.67 
 
 
619 aa  428  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  43.22 
 
 
615 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  43.22 
 
 
616 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  41.08 
 
 
624 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0755  peptidoglycan glycosyltransferase  41.49 
 
 
587 aa  428  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  41.32 
 
 
578 aa  423  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2924  penicillin-binding protein 3  41.3 
 
 
587 aa  422  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  42.25 
 
 
615 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  40.72 
 
 
615 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  40.72 
 
 
615 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  42.64 
 
 
615 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  40.72 
 
 
615 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3393  penicillin-binding protein  41.3 
 
 
587 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0604  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.71 
 
 
587 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3524  peptidoglycan glycosyltransferase  41.3 
 
 
587 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.568102  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  38.24 
 
 
610 aa  421  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  40.88 
 
 
578 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  40.29 
 
 
618 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>