More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1331 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
582 aa  1186    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  82.82 
 
 
575 aa  992    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  96.74 
 
 
578 aa  1146    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  83.7 
 
 
576 aa  1003    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  98.97 
 
 
582 aa  1174    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  82.39 
 
 
580 aa  1006    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  75.04 
 
 
579 aa  916    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  78.01 
 
 
579 aa  933    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  78.24 
 
 
579 aa  930    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  74.18 
 
 
575 aa  892    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  97.77 
 
 
583 aa  1144    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  50.45 
 
 
580 aa  567  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2968  penicillin-binding protein 3A  48.82 
 
 
565 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35190  penicillin-binding protein 3A  48.63 
 
 
565 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  50.45 
 
 
570 aa  547  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  47.51 
 
 
568 aa  539  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  51.33 
 
 
570 aa  536  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.34 
 
 
570 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.74 
 
 
571 aa  528  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  47.34 
 
 
622 aa  519  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  47.72 
 
 
613 aa  510  1e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  47.53 
 
 
613 aa  507  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  46.05 
 
 
587 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  46.97 
 
 
575 aa  503  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  47.73 
 
 
583 aa  503  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.9 
 
 
614 aa  504  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  45.44 
 
 
548 aa  487  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  45.44 
 
 
552 aa  488  1e-136  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  44.76 
 
 
578 aa  478  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  43.59 
 
 
553 aa  478  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  43.59 
 
 
553 aa  478  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  44.62 
 
 
577 aa  478  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.39 
 
 
619 aa  475  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  45.54 
 
 
587 aa  474  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00085  transpeptidase involved in septal peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 3)  46.13 
 
 
588 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3516  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.13 
 
 
588 aa  462  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0089  peptidoglycan synthetase FtsI  46.13 
 
 
588 aa  463  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679095  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3573  peptidoglycan glycosyltransferase  46.13 
 
 
588 aa  462  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00084  hypothetical protein  46.13 
 
 
588 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0092  peptidoglycan synthetase FtsI  46.13 
 
 
588 aa  462  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.948544 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0090  peptidoglycan synthetase FtsI  46.13 
 
 
588 aa  462  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0086  peptidoglycan synthetase FtsI  46.13 
 
 
588 aa  462  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.67693  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  44.72 
 
 
601 aa  462  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0077  peptidoglycan synthetase FtsI  46.13 
 
 
588 aa  462  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  43.48 
 
 
578 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0139  peptidoglycan synthetase FtsI  45.06 
 
 
588 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0134  peptidoglycan synthetase FtsI  45.06 
 
 
588 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  43.5 
 
 
578 aa  457  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0131  peptidoglycan synthetase FtsI  45.06 
 
 
588 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  43.55 
 
 
597 aa  456  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0134  peptidoglycan synthetase FtsI  45.06 
 
 
588 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000490417 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  44.1 
 
 
575 aa  456  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0138  peptidoglycan synthetase FtsI  45.06 
 
 
588 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.154008 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0755  peptidoglycan glycosyltransferase  43.13 
 
 
587 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  41.52 
 
 
578 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  42.13 
 
 
586 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0630  peptidoglycan synthetase FtsI  46.03 
 
 
588 aa  447  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  41.88 
 
 
578 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3393  penicillin-binding protein  42.78 
 
 
587 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3524  peptidoglycan glycosyltransferase  42.78 
 
 
587 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.568102  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3786  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.59 
 
 
587 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  41.7 
 
 
583 aa  445  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  41.7 
 
 
583 aa  445  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  42.39 
 
 
580 aa  444  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.34 
 
 
588 aa  445  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  41.7 
 
 
583 aa  445  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  41.52 
 
 
584 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  41.7 
 
 
583 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  41.52 
 
 
583 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2924  penicillin-binding protein 3  42.61 
 
 
587 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  41.52 
 
 
584 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  41.75 
 
 
582 aa  440  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.52 
 
 
584 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3598  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.77 
 
 
587 aa  442  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  41.94 
 
 
581 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  41.52 
 
 
584 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0604  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.23 
 
 
587 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3810  peptidoglycan glycosyltransferase  41.68 
 
 
582 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  41.34 
 
 
578 aa  438  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0642  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.78 
 
 
587 aa  435  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.407482  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  40.94 
 
 
581 aa  424  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  41.71 
 
 
607 aa  421  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  39.86 
 
 
582 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.07 
 
 
582 aa  422  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  40.07 
 
 
582 aa  421  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  41.06 
 
 
614 aa  421  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.44 
 
 
595 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.26 
 
 
595 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  39.96 
 
 
577 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  41.3 
 
 
621 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2650  peptidoglycan synthetase FtsI precursor (peptidoglycan glycosyltransferase 3) (penicillin-binding protein 3)  41.08 
 
 
579 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  40.72 
 
 
614 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  40.04 
 
 
580 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  41.53 
 
 
585 aa  418  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  40.47 
 
 
595 aa  415  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  40.72 
 
 
614 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  40.72 
 
 
614 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  41.38 
 
 
605 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  40.72 
 
 
614 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  40.72 
 
 
614 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>