More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1069 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  55.34 
 
 		 615 aa  656    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  58.57 
 
 		 595 aa  674    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  56.79 
 
 		 614 aa  660    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  58.51 
 
 		 600 aa  680    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  56.79 
 
 		 614 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  56.79 
 
 		 614 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  74.78 
 
 		 582 aa  901    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  56.17 
 
 		 615 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  89.93 
 
 		 578 aa  1082    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  56.79 
 
 		 614 aa  661    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  56.87 
 
 		 616 aa  659    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  56.79 
 
 		 615 aa  652    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  56.79 
 
 		 614 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  56.79 
 
 		 614 aa  660    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  63.89 
 
 		 614 aa  780    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  56.97 
 
 		 614 aa  664    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  75.86 
 
 		 580 aa  929    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  67.01 
 
 		 607 aa  811    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  100 
 
 		 577 aa  1178    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  56.37 
 
 		 621 aa  665    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  77.07 
 
 		 582 aa  924    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  58.16 
 
 		 605 aa  677    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  55.52 
 
 		 615 aa  657    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  56.79 
 
 		 614 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  58.22 
 
 		 595 aa  661    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  76.9 
 
 		 582 aa  923    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  56.72 
 
 		 615 aa  657    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  57.32 
 
 		 624 aa  675    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  75.43 
 
 		 580 aa  897    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  55.52 
 
 		 615 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  56.37 
 
 		 621 aa  664    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  87.39 
 
 		 582 aa  1046    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  58.04 
 
 		 595 aa  659    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  77.28 
 
 		 581 aa  930    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  54.53 
 
 		 590 aa  594  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  53.54 
 
 		 590 aa  594  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.62 
 
 		 588 aa  589  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  51.24 
 
 		 594 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  51.24 
 
 		 596 aa  589  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  51.41 
 
 		 594 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  51.24 
 
 		 594 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  51.24 
 
 		 594 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  51.24 
 
 		 631 aa  585  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  51.24 
 
 		 594 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  51.24 
 
 		 594 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  51.41 
 
 		 594 aa  588  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  50.88 
 
 		 632 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  50.88 
 
 		 632 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  51.5 
 
 		 630 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  50.88 
 
 		 632 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  51.06 
 
 		 630 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  50.44 
 
 		 582 aa  580  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  50.61 
 
 		 618 aa  578  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.99 
 
 		 577 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  50.9 
 
 		 577 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  50.27 
 
 		 583 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  49.64 
 
 		 578 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  50.81 
 
 		 587 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  44.1 
 
 		 575 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  43.99 
 
 		 577 aa  474  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.45 
 
 		 570 aa  474  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  44.42 
 
 		 552 aa  470  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  44.42 
 
 		 548 aa  470  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  42.32 
 
 		 580 aa  465  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.07 
 
 		 571 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  44.51 
 
 		 570 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  41.44 
 
 		 613 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  42.42 
 
 		 587 aa  448  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  40.79 
 
 		 613 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  42.27 
 
 		 579 aa  445  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  42.17 
 
 		 622 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.73 
 
 		 614 aa  437  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1750  penicillin-binding protein  42.4 
 
 		 570 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.25987  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  41.68 
 
 		 568 aa  435  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1244  penicillin-binding protein  42.4 
 
 		 570 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.313852  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1082  penicillin-binding protein  42.4 
 
 		 570 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.443552  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1661  penicillin-binding protein  42.22 
 
 		 570 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0239  penicillin-binding protein  42.22 
 
 		 615 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229072  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  41.9 
 
 		 570 aa  433  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0343  penicillin-binding protein  42.4 
 
 		 570 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.503077  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0562  peptidoglycan glycosyltransferase  39.02 
 
 		 577 aa  426  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.445743  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  40.45 
 
 		 553 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  41.32 
 
 		 578 aa  422  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  42.23 
 
 		 579 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  40.51 
 
 		 578 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  40.89 
 
 		 575 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  40.26 
 
 		 553 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  40.59 
 
 		 586 aa  420  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  40.15 
 
 		 583 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  42.23 
 
 		 579 aa  422  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  40.07 
 
 		 576 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  39.82 
 
 		 582 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  39.82 
 
 		 582 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  39.96 
 
 		 580 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  39.89 
 
 		 575 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  39.82 
 
 		 578 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2151  penicillin-binding protein, transpeptidase  41.5 
 
 		 581 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  39.82 
 
 		 583 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  39.82 
 
 		 583 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  39.46 
 
 		 578 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>