More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3431 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  56.81 
 
 
595 aa  635    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  66.32 
 
 
607 aa  803    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  57.47 
 
 
595 aa  659    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  54.77 
 
 
614 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  74.79 
 
 
582 aa  897    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  54.77 
 
 
614 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  73.71 
 
 
582 aa  895    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  54.77 
 
 
614 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  56.48 
 
 
600 aa  664    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  54.77 
 
 
614 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  74.79 
 
 
582 aa  897    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  54.77 
 
 
614 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  73.02 
 
 
582 aa  876    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  54.86 
 
 
615 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  55.21 
 
 
616 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  54.77 
 
 
614 aa  644    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
580 aa  1174    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  54.77 
 
 
614 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  75.86 
 
 
577 aa  929    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  55.03 
 
 
621 aa  651    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  55.73 
 
 
624 aa  657    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  57.17 
 
 
605 aa  669    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  54.56 
 
 
615 aa  646    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  54.39 
 
 
615 aa  644    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  74.01 
 
 
580 aa  877    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  54.77 
 
 
614 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  55.56 
 
 
621 aa  652    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  63.87 
 
 
614 aa  784    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  54.86 
 
 
615 aa  641    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  54.56 
 
 
615 aa  646    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  54.69 
 
 
615 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  77.05 
 
 
581 aa  925    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  74.44 
 
 
578 aa  905    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  56.64 
 
 
595 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  53.4 
 
 
588 aa  615  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  51.76 
 
 
582 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  51.37 
 
 
590 aa  584  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  51.13 
 
 
590 aa  571  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  51.08 
 
 
583 aa  570  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  49.74 
 
 
594 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  49.74 
 
 
594 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  49.56 
 
 
594 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  49.74 
 
 
594 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  49.74 
 
 
596 aa  561  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  49.74 
 
 
594 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  49.74 
 
 
594 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  50.09 
 
 
630 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  49.74 
 
 
594 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  49.65 
 
 
630 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  48.69 
 
 
632 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  48.69 
 
 
632 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  48.69 
 
 
632 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  48.51 
 
 
631 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  49.03 
 
 
618 aa  554  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.46 
 
 
577 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  49.37 
 
 
577 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  51.08 
 
 
587 aa  537  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  48.29 
 
 
578 aa  534  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  43.29 
 
 
577 aa  468  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  44.51 
 
 
552 aa  462  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  44.32 
 
 
575 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  44.51 
 
 
548 aa  461  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.13 
 
 
570 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  41.71 
 
 
613 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  41.54 
 
 
613 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.94 
 
 
571 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  42.57 
 
 
568 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  42.21 
 
 
553 aa  435  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  42.21 
 
 
553 aa  433  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  42.32 
 
 
622 aa  434  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.41 
 
 
614 aa  433  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  41.55 
 
 
580 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  43.97 
 
 
570 aa  431  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  41.83 
 
 
587 aa  425  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1750  penicillin-binding protein  41.43 
 
 
570 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.25987  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0239  penicillin-binding protein  41.61 
 
 
615 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229072  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  40.21 
 
 
570 aa  415  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  42.18 
 
 
579 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  41.38 
 
 
579 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  40.55 
 
 
578 aa  410  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1082  penicillin-binding protein  41.25 
 
 
570 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.443552  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1661  penicillin-binding protein  41.61 
 
 
570 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0562  peptidoglycan glycosyltransferase  37.67 
 
 
577 aa  411  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.445743  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0343  penicillin-binding protein  41.25 
 
 
570 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.503077  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  40.73 
 
 
586 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  40.28 
 
 
578 aa  411  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  41.82 
 
 
579 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1244  penicillin-binding protein  41.25 
 
 
570 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.313852  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2968  penicillin-binding protein 3A  40.04 
 
 
565 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  40.8 
 
 
578 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  40.26 
 
 
583 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  39.86 
 
 
576 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3810  peptidoglycan glycosyltransferase  40.91 
 
 
582 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35190  penicillin-binding protein 3A  39.67 
 
 
565 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  39.86 
 
 
575 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  39.86 
 
 
575 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  40.29 
 
 
580 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  40.04 
 
 
575 aa  398  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  39.74 
 
 
582 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  38.73 
 
 
583 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>