More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2850 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  67.78 
 
 
621 aa  816    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  100 
 
 
595 aa  1213    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  56.99 
 
 
582 aa  661    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  56.6 
 
 
582 aa  653    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  68.72 
 
 
614 aa  827    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  68.72 
 
 
614 aa  827    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  60.14 
 
 
590 aa  676    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  56.76 
 
 
582 aa  659    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  68.72 
 
 
614 aa  827    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  82.05 
 
 
600 aa  975    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  68.72 
 
 
614 aa  827    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  67.3 
 
 
615 aa  818    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  89.75 
 
 
595 aa  1100    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  68.72 
 
 
614 aa  827    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  57.22 
 
 
582 aa  667    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  68.01 
 
 
614 aa  819    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  57.47 
 
 
580 aa  659    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  56.64 
 
 
578 aa  662    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  58.57 
 
 
577 aa  674    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  67.43 
 
 
621 aa  816    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  90.08 
 
 
595 aa  1102    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  82.09 
 
 
605 aa  970    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  67.19 
 
 
615 aa  821    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  67.08 
 
 
624 aa  807    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  67.3 
 
 
615 aa  815    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  56.99 
 
 
582 aa  661    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  68.72 
 
 
614 aa  827    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  56.45 
 
 
581 aa  660    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  53.67 
 
 
614 aa  636    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  67.83 
 
 
615 aa  820    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  67.19 
 
 
615 aa  821    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  68.01 
 
 
616 aa  817    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  61.3 
 
 
590 aa  687    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  68.72 
 
 
614 aa  827    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  55.15 
 
 
607 aa  646    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  66.96 
 
 
615 aa  823    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  55.11 
 
 
580 aa  623  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  54.69 
 
 
618 aa  615  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  52.93 
 
 
588 aa  612  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  54.34 
 
 
631 aa  609  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  54.34 
 
 
632 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  54.34 
 
 
632 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  54.34 
 
 
632 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  53.48 
 
 
630 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  53.48 
 
 
630 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  52.85 
 
 
594 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  51.9 
 
 
594 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  52.08 
 
 
594 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  52.67 
 
 
594 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  52.67 
 
 
594 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  52.67 
 
 
594 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  52.49 
 
 
596 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  52.67 
 
 
594 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  50.78 
 
 
583 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  51.35 
 
 
578 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.46 
 
 
577 aa  556  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  49.55 
 
 
577 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  50.8 
 
 
587 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  44.58 
 
 
577 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  44.97 
 
 
575 aa  462  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  44.79 
 
 
553 aa  463  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.51 
 
 
571 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1750  penicillin-binding protein  46.4 
 
 
570 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.25987  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  44.61 
 
 
553 aa  461  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  45.8 
 
 
548 aa  459  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  45.8 
 
 
552 aa  459  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1082  penicillin-binding protein  46.04 
 
 
570 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.443552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0343  penicillin-binding protein  46.04 
 
 
570 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.503077  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1244  penicillin-binding protein  46.04 
 
 
570 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.313852  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0239  penicillin-binding protein  46.22 
 
 
615 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229072  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2151  penicillin-binding protein, transpeptidase  44.42 
 
 
581 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875245  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1661  penicillin-binding protein  46.22 
 
 
570 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  46.46 
 
 
570 aa  452  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0562  peptidoglycan glycosyltransferase  39.79 
 
 
577 aa  449  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.445743  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  43.45 
 
 
568 aa  451  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.92 
 
 
570 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  42.45 
 
 
587 aa  448  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.9 
 
 
614 aa  444  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  42.15 
 
 
580 aa  445  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  44.18 
 
 
622 aa  440  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  42.03 
 
 
613 aa  432  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  42.47 
 
 
579 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  43.07 
 
 
578 aa  433  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  42.44 
 
 
570 aa  430  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  42.36 
 
 
579 aa  432  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  42.36 
 
 
579 aa  432  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  42.03 
 
 
613 aa  431  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  42.29 
 
 
575 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  42.24 
 
 
578 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  41.52 
 
 
583 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  41.32 
 
 
583 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  42.06 
 
 
578 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  41.38 
 
 
580 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  41.68 
 
 
583 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  41.68 
 
 
583 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  41.68 
 
 
583 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  42.08 
 
 
575 aa  413  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  40.29 
 
 
583 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  41.38 
 
 
576 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2968  penicillin-binding protein 3A  40.04 
 
 
565 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>