More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0562 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0562  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 577 aa  1185    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.445743  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  41.07 
 
 		 583 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  40.42 
 
 		 595 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.49 
 
 		 595 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  39 
 
 		 571 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  42.42 
 
 		 587 aa  449  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.3 
 
 		 588 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.14 
 
 		 595 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  41.97 
 
 		 605 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  41.23 
 
 		 575 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  40.14 
 
 		 570 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  40.42 
 
 		 578 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  39.13 
 
 		 624 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.3 
 
 		 570 aa  438  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  38.07 
 
 		 582 aa  438  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  39.96 
 
 		 600 aa  438  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  38.75 
 
 		 614 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  39.54 
 
 		 582 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  38.95 
 
 		 601 aa  435  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  39.11 
 
 		 615 aa  435  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  39.44 
 
 		 583 aa  435  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  39.44 
 
 		 583 aa  435  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.21 
 
 		 582 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  39.11 
 
 		 615 aa  435  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  39.44 
 
 		 583 aa  435  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  39.11 
 
 		 615 aa  435  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  39.26 
 
 		 583 aa  432  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  37.83 
 
 		 577 aa  431  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  38.94 
 
 		 615 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  39.26 
 
 		 578 aa  431  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  38.56 
 
 		 578 aa  431  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  39.13 
 
 		 615 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  39.65 
 
 		 616 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  38 
 
 		 586 aa  431  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.74 
 
 		 621 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  39.65 
 
 		 614 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  39.65 
 
 		 614 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  38.77 
 
 		 597 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  38.72 
 
 		 587 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  39.65 
 
 		 614 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.64 
 
 		 582 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  39.65 
 
 		 614 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  39.65 
 
 		 614 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  39.65 
 
 		 614 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  39.65 
 
 		 614 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  39.02 
 
 		 577 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  37.39 
 
 		 621 aa  428  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  38.64 
 
 		 582 aa  427  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  38.81 
 
 		 581 aa  427  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  39.65 
 
 		 614 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  38.92 
 
 		 580 aa  428  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  39.08 
 
 		 578 aa  428  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  38.96 
 
 		 615 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  38.2 
 
 		 578 aa  426  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  38.91 
 
 		 583 aa  427  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  38.03 
 
 		 578 aa  423  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  38.38 
 
 		 584 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  38.38 
 
 		 584 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.38 
 
 		 584 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  38.38 
 
 		 584 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  37.8 
 
 		 579 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  37.98 
 
 		 579 aa  425  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2650  peptidoglycan synthetase FtsI precursor (peptidoglycan glycosyltransferase 3) (penicillin-binding protein 3)  40.76 
 
 		 579 aa  425  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  37.01 
 
 		 585 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  38.1 
 
 		 594 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  38.1 
 
 		 594 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  37.37 
 
 		 575 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  38.28 
 
 		 594 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  40.28 
 
 		 610 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  38.56 
 
 		 580 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  37.93 
 
 		 594 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  38.3 
 
 		 576 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  37.93 
 
 		 594 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  37.74 
 
 		 583 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  38.62 
 
 		 596 aa  415  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  38.03 
 
 		 568 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  37.93 
 
 		 594 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3810  peptidoglycan glycosyltransferase  38.03 
 
 		 582 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  37.04 
 
 		 579 aa  413  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  37.93 
 
 		 594 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  36.7 
 
 		 578 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  38.12 
 
 		 575 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  36.35 
 
 		 580 aa  412  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  38.6 
 
 		 580 aa  411  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  37.67 
 
 		 580 aa  411  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  38.03 
 
 		 581 aa  410  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  40.76 
 
 		 570 aa  412  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  36.56 
 
 		 607 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  37.72 
 
 		 582 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  38.46 
 
 		 553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  38.64 
 
 		 553 aa  408  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  37.54 
 
 		 582 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  37.88 
 
 		 613 aa  404  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  37.05 
 
 		 618 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.87 
 
 		 619 aa  403  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.23 
 
 		 614 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  38.05 
 
 		 613 aa  405  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  37.46 
 
 		 548 aa  402  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  37.52 
 
 		 632 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  37.46 
 
 		 552 aa  401  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>