More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2207 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
571 aa  1153    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  55.96 
 
 
570 aa  631  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  51.33 
 
 
570 aa  560  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  51.5 
 
 
583 aa  560  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  52.36 
 
 
578 aa  552  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  48.54 
 
 
579 aa  551  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  48.09 
 
 
579 aa  551  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  50.81 
 
 
575 aa  543  1e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  48 
 
 
579 aa  541  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  47.09 
 
 
578 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  46.99 
 
 
583 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  47.33 
 
 
622 aa  531  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  46.88 
 
 
582 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  46.51 
 
 
582 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.69 
 
 
614 aa  525  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  48.62 
 
 
580 aa  523  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  49.63 
 
 
587 aa  520  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  49.72 
 
 
570 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  49.37 
 
 
575 aa  514  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  45.61 
 
 
576 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  44.18 
 
 
580 aa  515  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  46.18 
 
 
613 aa  509  1e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  45.61 
 
 
575 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  48.54 
 
 
577 aa  509  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  44.46 
 
 
553 aa  508  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  44.28 
 
 
553 aa  506  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  46 
 
 
613 aa  508  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  46.53 
 
 
575 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  46.49 
 
 
587 aa  501  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.3 
 
 
588 aa  494  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  45.32 
 
 
548 aa  493  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  45.32 
 
 
552 aa  493  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  44.57 
 
 
597 aa  487  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  43.76 
 
 
568 aa  482  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  42.81 
 
 
582 aa  478  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  43.45 
 
 
601 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  42.91 
 
 
581 aa  472  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  44.61 
 
 
578 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.4 
 
 
619 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  44.14 
 
 
595 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  42.52 
 
 
586 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  43.41 
 
 
600 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  42.73 
 
 
582 aa  464  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  42.63 
 
 
578 aa  462  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  43.7 
 
 
605 aa  459  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  42.34 
 
 
580 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  42.01 
 
 
578 aa  457  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  41.89 
 
 
596 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  42.26 
 
 
582 aa  456  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.26 
 
 
582 aa  457  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  42.27 
 
 
630 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  42.1 
 
 
630 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  42.78 
 
 
580 aa  458  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  41.61 
 
 
578 aa  455  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  42.08 
 
 
594 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.29 
 
 
595 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  42.08 
 
 
594 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  41.74 
 
 
618 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  42.08 
 
 
594 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  42.26 
 
 
594 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0562  peptidoglycan glycosyltransferase  38.15 
 
 
577 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.445743  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  42.08 
 
 
594 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  41.79 
 
 
577 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  42.08 
 
 
594 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  42.08 
 
 
594 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.5 
 
 
595 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  41.89 
 
 
578 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  43.53 
 
 
614 aa  452  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  41.35 
 
 
632 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.81 
 
 
577 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  42.62 
 
 
580 aa  451  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  41.35 
 
 
632 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  41.35 
 
 
632 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00085  transpeptidase involved in septal peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 3)  42.63 
 
 
588 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3516  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.63 
 
 
588 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0086  peptidoglycan synthetase FtsI  42.63 
 
 
588 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.67693  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0134  peptidoglycan synthetase FtsI  42.83 
 
 
588 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000490417 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00084  hypothetical protein  42.63 
 
 
588 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0131  peptidoglycan synthetase FtsI  42.83 
 
 
588 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3573  peptidoglycan glycosyltransferase  42.63 
 
 
588 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  41.37 
 
 
578 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.77 
 
 
594 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0139  peptidoglycan synthetase FtsI  42.83 
 
 
588 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  42.91 
 
 
585 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3393  penicillin-binding protein  42.15 
 
 
587 aa  445  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  42.15 
 
 
624 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  42.47 
 
 
621 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3524  peptidoglycan glycosyltransferase  42.15 
 
 
587 aa  445  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.568102  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  41.11 
 
 
578 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0077  peptidoglycan synthetase FtsI  42.63 
 
 
588 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0134  peptidoglycan synthetase FtsI  42.83 
 
 
588 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0092  peptidoglycan synthetase FtsI  42.63 
 
 
588 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.948544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.53 
 
 
582 aa  448  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0089  peptidoglycan synthetase FtsI  42.81 
 
 
588 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679095  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0090  peptidoglycan synthetase FtsI  42.63 
 
 
588 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0138  peptidoglycan synthetase FtsI  42.83 
 
 
588 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.154008 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  44.77 
 
 
594 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  41.37 
 
 
584 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  42.08 
 
 
581 aa  444  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  41.64 
 
 
614 aa  445  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>