More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4990 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  77.32 
 
 		 582 aa  918    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  74.48 
 
 		 575 aa  877    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  78.22 
 
 		 583 aa  936    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  74.87 
 
 		 576 aa  880    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  75.81 
 
 		 580 aa  919    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  100 
 
 		 579 aa  1180    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  78.35 
 
 		 582 aa  921    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  76.52 
 
 		 579 aa  916    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  99.31 
 
 		 579 aa  1174    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  78.55 
 
 		 578 aa  942    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  75.26 
 
 		 575 aa  880    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  51.23 
 
 		 580 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  51.42 
 
 		 570 aa  568  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  51.68 
 
 		 570 aa  567  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2968  penicillin-binding protein 3A  49.02 
 
 		 565 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  49.28 
 
 		 568 aa  551  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35190  penicillin-binding protein 3A  48.48 
 
 		 565 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  50.94 
 
 		 570 aa  549  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  49.27 
 
 		 622 aa  548  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.96 
 
 		 571 aa  547  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  49.1 
 
 		 587 aa  540  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  47.25 
 
 		 613 aa  525  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  47.44 
 
 		 613 aa  525  1e-147  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  48.11 
 
 		 583 aa  520  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.73 
 
 		 614 aa  518  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  46.97 
 
 		 575 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  46.94 
 
 		 577 aa  508  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  46.32 
 
 		 553 aa  496  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  46.51 
 
 		 553 aa  498  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  46.8 
 
 		 552 aa  496  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  46.8 
 
 		 548 aa  496  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  46.08 
 
 		 578 aa  491  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0089  peptidoglycan synthetase FtsI  45.45 
 
 		 588 aa  479  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  45.37 
 
 		 578 aa  481  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00085  transpeptidase involved in septal peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 3)  45.28 
 
 		 588 aa  478  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3516  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.28 
 
 		 588 aa  478  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0086  peptidoglycan synthetase FtsI  45.28 
 
 		 588 aa  478  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.67693  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3573  peptidoglycan glycosyltransferase  45.28 
 
 		 588 aa  478  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  45.49 
 
 		 601 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00084  hypothetical protein  45.28 
 
 		 588 aa  478  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  44.95 
 
 		 597 aa  478  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.91 
 
 		 619 aa  478  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0092  peptidoglycan synthetase FtsI  45.28 
 
 		 588 aa  478  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.948544 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  44.12 
 
 		 578 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0090  peptidoglycan synthetase FtsI  45.28 
 
 		 588 aa  478  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0077  peptidoglycan synthetase FtsI  45.28 
 
 		 588 aa  478  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0134  peptidoglycan synthetase FtsI  44.43 
 
 		 588 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0134  peptidoglycan synthetase FtsI  44.43 
 
 		 588 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000490417 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0138  peptidoglycan synthetase FtsI  44.43 
 
 		 588 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.154008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0131  peptidoglycan synthetase FtsI  44.43 
 
 		 588 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0139  peptidoglycan synthetase FtsI  44.43 
 
 		 588 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  43.21 
 
 		 584 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0755  peptidoglycan glycosyltransferase  43.93 
 
 		 587 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.21 
 
 		 584 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  43.21 
 
 		 584 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  44.27 
 
 		 587 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  44.57 
 
 		 580 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  43.21 
 
 		 584 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  43.94 
 
 		 578 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  43.18 
 
 		 583 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  42.48 
 
 		 583 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  44.44 
 
 		 575 aa  468  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  43.45 
 
 		 581 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3393  penicillin-binding protein  43.76 
 
 		 587 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2924  penicillin-binding protein 3  43.59 
 
 		 587 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  42.48 
 
 		 583 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  42.48 
 
 		 583 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  42.48 
 
 		 583 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3524  peptidoglycan glycosyltransferase  43.76 
 
 		 587 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.568102  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0630  peptidoglycan synthetase FtsI  45.11 
 
 		 588 aa  464  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3786  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.93 
 
 		 587 aa  463  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3810  peptidoglycan glycosyltransferase  42.96 
 
 		 582 aa  462  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  42.68 
 
 		 578 aa  462  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3598  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.42 
 
 		 587 aa  460  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0604  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.52 
 
 		 587 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0642  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.01 
 
 		 587 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.407482  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  42.93 
 
 		 586 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.75 
 
 		 588 aa  461  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  43.09 
 
 		 582 aa  457  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  42.31 
 
 		 578 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2650  peptidoglycan synthetase FtsI precursor (peptidoglycan glycosyltransferase 3) (penicillin-binding protein 3)  43.68 
 
 		 579 aa  445  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  43.51 
 
 		 607 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1479  peptidoglycan synthetase FtsI  42.5 
 
 		 581 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0193532  normal  0.796051 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  42.55 
 
 		 581 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1980  peptidoglycan synthetase FtsI  42.5 
 
 		 581 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0756202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1295  peptidoglycan synthetase FtsI  42.5 
 
 		 581 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103537  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1976  peptidoglycan synthetase FtsI  42.5 
 
 		 581 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0049201  normal  0.138464 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2037  peptidoglycan synthetase FtsI  42.5 
 
 		 581 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  42.57 
 
 		 580 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  42.36 
 
 		 595 aa  432  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  41.43 
 
 		 585 aa  431  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.86 
 
 		 582 aa  431  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  42.86 
 
 		 582 aa  431  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  42.31 
 
 		 594 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  42.31 
 
 		 594 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.13 
 
 		 582 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  41.97 
 
 		 614 aa  426  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  41.58 
 
 		 578 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  42.31 
 
 		 594 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  42 
 
 		 595 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>