More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0113 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  100 
 
 
577 aa  1164    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  51.87 
 
 
583 aa  587  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  50.18 
 
 
582 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.82 
 
 
570 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  48.57 
 
 
614 aa  526  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  51.02 
 
 
587 aa  526  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.47 
 
 
588 aa  526  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  47.11 
 
 
579 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.34 
 
 
571 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  46.94 
 
 
579 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  45.34 
 
 
607 aa  495  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  44.58 
 
 
595 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  45 
 
 
600 aa  490  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  48.26 
 
 
570 aa  486  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.68 
 
 
595 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.51 
 
 
595 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  43.52 
 
 
624 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  46.36 
 
 
575 aa  478  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  46.38 
 
 
579 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  44.83 
 
 
605 aa  480  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  46.18 
 
 
578 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  43.62 
 
 
615 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  43.26 
 
 
615 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  43.26 
 
 
615 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  44.93 
 
 
578 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  46.46 
 
 
575 aa  476  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  43.62 
 
 
615 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  43.26 
 
 
616 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.64 
 
 
582 aa  477  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  43.62 
 
 
615 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  43.62 
 
 
615 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  44.21 
 
 
581 aa  478  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  43.49 
 
 
578 aa  478  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  43.99 
 
 
577 aa  474  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  43.56 
 
 
621 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  45.21 
 
 
583 aa  475  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  45.55 
 
 
630 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.39 
 
 
621 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  45.63 
 
 
594 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  45.63 
 
 
594 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.53 
 
 
582 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  45.83 
 
 
594 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  45.63 
 
 
594 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  45.72 
 
 
630 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  45.81 
 
 
594 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  45.63 
 
 
594 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  44.66 
 
 
580 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  45.63 
 
 
594 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  45.07 
 
 
582 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  44.69 
 
 
553 aa  468  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  44.69 
 
 
553 aa  467  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  44.5 
 
 
576 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  44.76 
 
 
618 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  44.7 
 
 
596 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  45.07 
 
 
582 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  43.29 
 
 
580 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  45.16 
 
 
632 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  44.44 
 
 
580 aa  468  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  45.16 
 
 
632 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  45.16 
 
 
632 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  42.35 
 
 
582 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  44.87 
 
 
575 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  45.24 
 
 
587 aa  464  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  41.92 
 
 
614 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  43.39 
 
 
582 aa  463  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  41.92 
 
 
614 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  44.32 
 
 
590 aa  459  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  41.92 
 
 
614 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  41.92 
 
 
614 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  44.62 
 
 
631 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  41.92 
 
 
614 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  41.92 
 
 
614 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  41.92 
 
 
614 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.74 
 
 
577 aa  458  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  46.07 
 
 
548 aa  455  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  41.39 
 
 
614 aa  458  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  46.07 
 
 
552 aa  456  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  44.31 
 
 
577 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  45.01 
 
 
570 aa  455  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.78 
 
 
590 aa  458  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  43.04 
 
 
580 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  43.95 
 
 
578 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  41.97 
 
 
578 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  46.17 
 
 
575 aa  449  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  42.83 
 
 
568 aa  451  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  43.14 
 
 
583 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.05 
 
 
614 aa  438  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  41.62 
 
 
586 aa  433  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  42.78 
 
 
583 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  42.78 
 
 
583 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  42.78 
 
 
583 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  42.73 
 
 
583 aa  432  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  43.02 
 
 
622 aa  430  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0562  peptidoglycan glycosyltransferase  38.18 
 
 
577 aa  427  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.445743  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  42.21 
 
 
584 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  40.73 
 
 
578 aa  422  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  42.11 
 
 
584 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.21 
 
 
584 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  42.21 
 
 
584 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2968  penicillin-binding protein 3A  40.37 
 
 
565 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>