More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3649 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  88.08 
 
 
618 aa  1120    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  81.9 
 
 
594 aa  993    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  81.73 
 
 
594 aa  991    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  90.94 
 
 
632 aa  1132    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  76.52 
 
 
577 aa  908    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  81.73 
 
 
594 aa  991    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  81.86 
 
 
594 aa  994    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  91.1 
 
 
631 aa  1131    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  98.57 
 
 
630 aa  1260    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  81.86 
 
 
594 aa  992    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  81.48 
 
 
596 aa  999    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  75.65 
 
 
577 aa  901    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  75.43 
 
 
578 aa  909    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  90.94 
 
 
632 aa  1132    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  81.73 
 
 
594 aa  991    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  81.73 
 
 
594 aa  991    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
630 aa  1277    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  90.94 
 
 
632 aa  1132    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  53.25 
 
 
581 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  53.48 
 
 
595 aa  599  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  49.59 
 
 
624 aa  592  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  51.84 
 
 
595 aa  591  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  51.85 
 
 
582 aa  591  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  51.84 
 
 
595 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  51.49 
 
 
582 aa  588  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  52.63 
 
 
580 aa  587  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  52.57 
 
 
614 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  51.23 
 
 
582 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  52.57 
 
 
614 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  52.57 
 
 
614 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  52.05 
 
 
600 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  52.57 
 
 
614 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  51.5 
 
 
577 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  52.57 
 
 
614 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  52.57 
 
 
614 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  52.57 
 
 
614 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  52.04 
 
 
614 aa  581  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  52.75 
 
 
605 aa  578  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  51.23 
 
 
582 aa  580  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  50.97 
 
 
578 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  50.86 
 
 
615 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  52.31 
 
 
616 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  50.77 
 
 
615 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  50.26 
 
 
615 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  49.74 
 
 
614 aa  573  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  50.09 
 
 
615 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  50.17 
 
 
615 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  50.17 
 
 
615 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.53 
 
 
621 aa  570  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  50.61 
 
 
582 aa  565  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  50.35 
 
 
621 aa  568  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  50.09 
 
 
580 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  49.2 
 
 
607 aa  553  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  48.05 
 
 
590 aa  511  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  47.76 
 
 
583 aa  511  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.98 
 
 
588 aa  505  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.34 
 
 
590 aa  505  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1661  penicillin-binding protein  47.46 
 
 
570 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1082  penicillin-binding protein  47.46 
 
 
570 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.443552  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0239  penicillin-binding protein  47.46 
 
 
615 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229072  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.23 
 
 
570 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1244  penicillin-binding protein  47.46 
 
 
570 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.313852  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0343  penicillin-binding protein  47.46 
 
 
570 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.503077  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1750  penicillin-binding protein  47.29 
 
 
570 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.25987  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  45.72 
 
 
577 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  45.21 
 
 
587 aa  456  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.52 
 
 
571 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  43.45 
 
 
570 aa  442  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  41.92 
 
 
622 aa  434  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  43.53 
 
 
552 aa  434  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  43.53 
 
 
548 aa  433  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  42.29 
 
 
613 aa  430  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  42.73 
 
 
575 aa  431  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  43.42 
 
 
570 aa  429  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  41.81 
 
 
587 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3810  peptidoglycan glycosyltransferase  41.39 
 
 
582 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  42.29 
 
 
613 aa  432  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  40.75 
 
 
578 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  40.93 
 
 
583 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  42.96 
 
 
553 aa  425  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  42.78 
 
 
553 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  42.03 
 
 
579 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  40.57 
 
 
583 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  40.57 
 
 
583 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  42.21 
 
 
579 aa  425  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  40.57 
 
 
583 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  41.29 
 
 
583 aa  425  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  40.75 
 
 
584 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  40.75 
 
 
584 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.75 
 
 
584 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  40.75 
 
 
584 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  42.11 
 
 
578 aa  418  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  40.85 
 
 
580 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  39.32 
 
 
578 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  40.87 
 
 
578 aa  413  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  40.88 
 
 
568 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  39.96 
 
 
586 aa  412  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  39.14 
 
 
578 aa  411  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  39.06 
 
 
581 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  39.1 
 
 
610 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>