More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0161 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  92.71 
 
 		 590 aa  1097    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  61.3 
 
 		 595 aa  709    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  57.54 
 
 		 616 aa  673    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  55.46 
 
 		 615 aa  669    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  56.92 
 
 		 614 aa  670    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  56.92 
 
 		 614 aa  669    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  57.07 
 
 		 621 aa  675    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  61.71 
 
 		 595 aa  701    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  61.07 
 
 		 600 aa  711    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 590 aa  1208    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  56.92 
 
 		 614 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  56.13 
 
 		 615 aa  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  56.92 
 
 		 614 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  61.71 
 
 		 595 aa  702    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  56.92 
 
 		 614 aa  672    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  57.07 
 
 		 621 aa  677    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  57.84 
 
 		 624 aa  681    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  56.92 
 
 		 614 aa  669    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  61.3 
 
 		 605 aa  696    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  56.94 
 
 		 615 aa  676    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  56.92 
 
 		 614 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  56.92 
 
 		 614 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  56.13 
 
 		 615 aa  676    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  56.94 
 
 		 615 aa  676    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  56.7 
 
 		 615 aa  673    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  53.54 
 
 		 577 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  51.97 
 
 		 582 aa  595  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  52.16 
 
 		 578 aa  593  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  52.19 
 
 		 607 aa  593  1e-168  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  51.37 
 
 		 580 aa  588  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  51.63 
 
 		 582 aa  587  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  52.04 
 
 		 582 aa  586  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  51.63 
 
 		 582 aa  587  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  50.62 
 
 		 614 aa  573  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  50.69 
 
 		 582 aa  572  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  50.6 
 
 		 581 aa  570  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  52.27 
 
 		 580 aa  566  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.88 
 
 		 588 aa  545  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  50.09 
 
 		 578 aa  531  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  47.35 
 
 		 632 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  46.86 
 
 		 596 aa  528  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  47.35 
 
 		 632 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  47.35 
 
 		 632 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  47.44 
 
 		 618 aa  525  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  48.05 
 
 		 630 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  47.27 
 
 		 631 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  48.05 
 
 		 630 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  46.78 
 
 		 594 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  46.61 
 
 		 594 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  46.61 
 
 		 594 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  46.61 
 
 		 594 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  46.61 
 
 		 594 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  46.61 
 
 		 594 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  47.64 
 
 		 583 aa  518  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  46.78 
 
 		 594 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.8 
 
 		 577 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  47.67 
 
 		 577 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  46.8 
 
 		 587 aa  480  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  44.32 
 
 		 577 aa  463  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.42 
 
 		 570 aa  435  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  45.38 
 
 		 570 aa  424  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  42.86 
 
 		 575 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  41.65 
 
 		 568 aa  414  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  41.59 
 
 		 597 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  41.95 
 
 		 580 aa  413  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  42.81 
 
 		 548 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  40.07 
 
 		 587 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  42.81 
 
 		 552 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  41.05 
 
 		 601 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  40.64 
 
 		 578 aa  398  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  40.26 
 
 		 586 aa  395  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  40.11 
 
 		 578 aa  398  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.55 
 
 		 571 aa  395  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  40.93 
 
 		 570 aa  395  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  39.93 
 
 		 578 aa  393  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1082  penicillin-binding protein  41.64 
 
 		 570 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.443552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1244  penicillin-binding protein  41.64 
 
 		 570 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.313852  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0239  penicillin-binding protein  41.82 
 
 		 615 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229072  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0343  penicillin-binding protein  41.64 
 
 		 570 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.503077  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  41.64 
 
 		 613 aa  390  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  38.13 
 
 		 581 aa  390  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2151  penicillin-binding protein, transpeptidase  40.22 
 
 		 581 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  39.36 
 
 		 578 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  39.96 
 
 		 579 aa  392  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  39.68 
 
 		 578 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  41.74 
 
 		 613 aa  391  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1750  penicillin-binding protein  41.82 
 
 		 570 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.25987  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0139  peptidoglycan synthetase FtsI  39.53 
 
 		 588 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0134  peptidoglycan synthetase FtsI  39.53 
 
 		 588 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000490417 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  40.51 
 
 		 575 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  39.72 
 
 		 578 aa  389  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  38.55 
 
 		 580 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0134  peptidoglycan synthetase FtsI  39.53 
 
 		 588 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0138  peptidoglycan synthetase FtsI  39.53 
 
 		 588 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.154008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0131  peptidoglycan synthetase FtsI  39.53 
 
 		 588 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1661  penicillin-binding protein  41.82 
 
 		 570 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3516  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.34 
 
 		 588 aa  383  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0090  peptidoglycan synthetase FtsI  39.34 
 
 		 588 aa  383  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  39.01 
 
 		 583 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  38.91 
 
 		 579 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>