More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2151 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_2151  penicillin-binding protein, transpeptidase  100 
 
 
581 aa  1174    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875245  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  44.42 
 
 
595 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.24 
 
 
595 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  44.28 
 
 
621 aa  452  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  44.34 
 
 
614 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  44.34 
 
 
614 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  44.34 
 
 
614 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  44.34 
 
 
614 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  44.34 
 
 
614 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  44.34 
 
 
614 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.1 
 
 
621 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  44.34 
 
 
614 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.06 
 
 
595 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  44 
 
 
616 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  44.46 
 
 
624 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  43.8 
 
 
614 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  44.55 
 
 
615 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  43.51 
 
 
600 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  44.73 
 
 
615 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  44.36 
 
 
615 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  44.36 
 
 
615 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  44.36 
 
 
615 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  44.73 
 
 
615 aa  438  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  44.06 
 
 
605 aa  432  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  42.02 
 
 
578 aa  415  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  41.5 
 
 
577 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  41.71 
 
 
618 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.44 
 
 
582 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  41.17 
 
 
632 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  41.27 
 
 
582 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  41.17 
 
 
632 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  41.17 
 
 
632 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  41.89 
 
 
630 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.09 
 
 
582 aa  392  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  40.87 
 
 
581 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  41.71 
 
 
630 aa  389  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  40.62 
 
 
631 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  40.62 
 
 
596 aa  385  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  40.8 
 
 
580 aa  385  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  41.17 
 
 
577 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  40.48 
 
 
614 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  41.2 
 
 
594 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  41.2 
 
 
594 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  41.2 
 
 
594 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  41.2 
 
 
594 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  41.06 
 
 
607 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  41.17 
 
 
594 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  41.2 
 
 
594 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  40.07 
 
 
582 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  41.2 
 
 
594 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  40.37 
 
 
578 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.08 
 
 
590 aa  375  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  40.22 
 
 
590 aa  375  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  39.6 
 
 
582 aa  371  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.11 
 
 
577 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  39.71 
 
 
580 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.89 
 
 
588 aa  361  3e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  37.91 
 
 
553 aa  354  2e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  37.73 
 
 
553 aa  353  4e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  39.85 
 
 
552 aa  348  1e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  39.85 
 
 
548 aa  348  1e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  38.7 
 
 
587 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.28 
 
 
614 aa  335  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  37.78 
 
 
577 aa  334  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  38.88 
 
 
570 aa  335  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  38 
 
 
578 aa  334  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.99 
 
 
571 aa  331  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  37.66 
 
 
579 aa  329  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  37.91 
 
 
570 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  38.1 
 
 
583 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  37.61 
 
 
578 aa  326  9e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  38.8 
 
 
622 aa  326  9e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.14 
 
 
570 aa  323  5e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1082  penicillin-binding protein  38.18 
 
 
570 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.443552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1244  penicillin-binding protein  38.18 
 
 
570 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.313852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  36.59 
 
 
578 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0343  penicillin-binding protein  38.18 
 
 
570 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.503077  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0239  penicillin-binding protein  37.14 
 
 
615 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229072  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  37.52 
 
 
613 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  37.07 
 
 
578 aa  321  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  37.52 
 
 
613 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1750  penicillin-binding protein  38.16 
 
 
570 aa  319  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.25987  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0562  peptidoglycan glycosyltransferase  35.08 
 
 
577 aa  317  3e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.445743  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  36.33 
 
 
586 aa  316  6e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1661  penicillin-binding protein  38 
 
 
570 aa  316  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  39.12 
 
 
578 aa  316  9e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  36.05 
 
 
597 aa  314  3.9999999999999997e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  35.73 
 
 
578 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  34.42 
 
 
610 aa  311  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  35.69 
 
 
601 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.46 
 
 
619 aa  309  8e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  35.38 
 
 
580 aa  309  9e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  36.53 
 
 
575 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  36.49 
 
 
587 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  35.37 
 
 
579 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3524  peptidoglycan glycosyltransferase  34.65 
 
 
587 aa  304  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.568102  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3393  penicillin-binding protein  34.65 
 
 
587 aa  304  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0604  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.55 
 
 
587 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  35.37 
 
 
579 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2037  peptidoglycan synthetase FtsI  34.58 
 
 
581 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00133127  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>