More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0131 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00085  transpeptidase involved in septal peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 3)  96.09 
 
 
588 aa  1167    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3516  Peptidoglycan glycosyltransferase  96.09 
 
 
588 aa  1167    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2924  penicillin-binding protein 3  84.59 
 
 
587 aa  1033    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0092  peptidoglycan synthetase FtsI  96.09 
 
 
588 aa  1167    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.948544 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1976  peptidoglycan synthetase FtsI  63.4 
 
 
581 aa  767    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0049201  normal  0.138464 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0131  peptidoglycan synthetase FtsI  100 
 
 
588 aa  1201    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0630  peptidoglycan synthetase FtsI  94.39 
 
 
588 aa  1110    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0134  peptidoglycan synthetase FtsI  99.83 
 
 
588 aa  1200    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3524  peptidoglycan glycosyltransferase  84.76 
 
 
587 aa  1035    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.568102  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00084  hypothetical protein  96.09 
 
 
588 aa  1167    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0134  peptidoglycan synthetase FtsI  99.83 
 
 
588 aa  1200    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000490417 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0089  peptidoglycan synthetase FtsI  96.09 
 
 
588 aa  1167    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679095  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0139  peptidoglycan synthetase FtsI  99.83 
 
 
588 aa  1200    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1295  peptidoglycan synthetase FtsI  63.4 
 
 
581 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103537  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3393  penicillin-binding protein  84.76 
 
 
587 aa  1035    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0138  peptidoglycan synthetase FtsI  99.83 
 
 
588 aa  1200    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.154008 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3573  peptidoglycan glycosyltransferase  96.09 
 
 
588 aa  1167    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0086  peptidoglycan synthetase FtsI  96.09 
 
 
588 aa  1167    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.67693  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0642  Peptidoglycan glycosyltransferase  83.42 
 
 
587 aa  1000    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.407482  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0604  Peptidoglycan glycosyltransferase  83.59 
 
 
587 aa  1021    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2392  peptidoglycan synthetase FtsI  63.33 
 
 
572 aa  734    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00596115  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0077  peptidoglycan synthetase FtsI  96.09 
 
 
588 aa  1167    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0090  peptidoglycan synthetase FtsI  96.26 
 
 
588 aa  1168    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1479  peptidoglycan synthetase FtsI  63.22 
 
 
581 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0193532  normal  0.796051 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3598  Peptidoglycan glycosyltransferase  85.81 
 
 
587 aa  1054    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3786  Peptidoglycan glycosyltransferase  86.15 
 
 
587 aa  1061    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1980  peptidoglycan synthetase FtsI  63.4 
 
 
581 aa  767    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0756202  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0755  peptidoglycan glycosyltransferase  84.79 
 
 
587 aa  1040    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2037  peptidoglycan synthetase FtsI  63.4 
 
 
581 aa  767    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00133127  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0352  peptidoglycan synthetase FtsI  53.53 
 
 
599 aa  620  1e-176  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2357  peptidoglycan glycosyltransferase  54.08 
 
 
572 aa  605  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  49.2 
 
 
597 aa  585  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  49.21 
 
 
601 aa  586  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2650  peptidoglycan synthetase FtsI precursor (peptidoglycan glycosyltransferase 3) (penicillin-binding protein 3)  50.97 
 
 
579 aa  582  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  50.36 
 
 
580 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  48.76 
 
 
586 aa  567  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  48.42 
 
 
583 aa  557  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  48.21 
 
 
578 aa  553  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  48.04 
 
 
578 aa  553  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2124  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.9 
 
 
568 aa  552  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.23462  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  48.68 
 
 
583 aa  554  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  48.68 
 
 
583 aa  555  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  48.68 
 
 
583 aa  554  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  48.01 
 
 
578 aa  552  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  48.24 
 
 
583 aa  551  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  48.39 
 
 
578 aa  550  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  48.15 
 
 
584 aa  548  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  47.32 
 
 
578 aa  548  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.15 
 
 
584 aa  548  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  48.15 
 
 
584 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  48.15 
 
 
584 aa  548  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3810  peptidoglycan glycosyltransferase  49.29 
 
 
582 aa  544  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  47.52 
 
 
581 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  46.53 
 
 
585 aa  530  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  47.05 
 
 
610 aa  503  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4471  peptidoglycan synthetase FtsI  45.69 
 
 
591 aa  491  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.79 
 
 
570 aa  480  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  44.43 
 
 
579 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  44.97 
 
 
622 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  44.64 
 
 
579 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  44.39 
 
 
578 aa  468  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.98 
 
 
614 aa  463  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  42.74 
 
 
613 aa  464  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  46.49 
 
 
583 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  46.31 
 
 
578 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  42.22 
 
 
613 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  46 
 
 
582 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  45.82 
 
 
582 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  44.01 
 
 
576 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  43.98 
 
 
570 aa  444  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  42.98 
 
 
579 aa  442  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  41.13 
 
 
580 aa  443  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  42.86 
 
 
587 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.15 
 
 
571 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  42.86 
 
 
575 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  43.83 
 
 
575 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  42.17 
 
 
580 aa  438  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  41.91 
 
 
582 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  42.54 
 
 
583 aa  434  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  42.08 
 
 
552 aa  430  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  42.08 
 
 
548 aa  431  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.14 
 
 
619 aa  426  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  42.99 
 
 
575 aa  423  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.74 
 
 
588 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  41.82 
 
 
570 aa  420  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  41.67 
 
 
587 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  39.21 
 
 
577 aa  413  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  40.18 
 
 
568 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2968  penicillin-binding protein 3A  41.92 
 
 
565 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.77 
 
 
621 aa  412  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  41.59 
 
 
621 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  40.18 
 
 
575 aa  412  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  41.49 
 
 
615 aa  412  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  41.52 
 
 
614 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  41.52 
 
 
614 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  41.42 
 
 
600 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  41.52 
 
 
614 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  41.52 
 
 
614 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  41.52 
 
 
614 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  41.49 
 
 
615 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>