More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2124 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2124  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 568 aa  1164    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.23462  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2357  peptidoglycan glycosyltransferase  56.81 
 
 		 572 aa  660    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0138  peptidoglycan synthetase FtsI  50.18 
 
 		 588 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.154008 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0134  peptidoglycan synthetase FtsI  50.18 
 
 		 588 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0134  peptidoglycan synthetase FtsI  50.18 
 
 		 588 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000490417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0139  peptidoglycan synthetase FtsI  50.18 
 
 		 588 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0131  peptidoglycan synthetase FtsI  50.18 
 
 		 588 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00085  transpeptidase involved in septal peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 3)  50.91 
 
 		 588 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3516  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.91 
 
 		 588 aa  546  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0092  peptidoglycan synthetase FtsI  50.91 
 
 		 588 aa  546  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.948544 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0090  peptidoglycan synthetase FtsI  50.45 
 
 		 588 aa  546  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00084  hypothetical protein  50.91 
 
 		 588 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3573  peptidoglycan glycosyltransferase  50.91 
 
 		 588 aa  546  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0077  peptidoglycan synthetase FtsI  50.91 
 
 		 588 aa  546  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0089  peptidoglycan synthetase FtsI  50.45 
 
 		 588 aa  546  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0086  peptidoglycan synthetase FtsI  50.91 
 
 		 588 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.67693  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0604  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.36 
 
 		 587 aa  544  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2924  penicillin-binding protein 3  49.82 
 
 		 587 aa  535  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3524  peptidoglycan glycosyltransferase  49.82 
 
 		 587 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.568102  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0755  peptidoglycan glycosyltransferase  49.73 
 
 		 587 aa  538  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1976  peptidoglycan synthetase FtsI  49.11 
 
 		 581 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0049201  normal  0.138464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3393  penicillin-binding protein  49.82 
 
 		 587 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2037  peptidoglycan synthetase FtsI  49.11 
 
 		 581 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1980  peptidoglycan synthetase FtsI  49.11 
 
 		 581 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0756202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1295  peptidoglycan synthetase FtsI  49.11 
 
 		 581 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1479  peptidoglycan synthetase FtsI  48.93 
 
 		 581 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0193532  normal  0.796051 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3786  Peptidoglycan glycosyltransferase  49 
 
 		 587 aa  532  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3598  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.64 
 
 		 587 aa  530  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0642  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.36 
 
 		 587 aa  526  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.407482  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0630  peptidoglycan synthetase FtsI  50.86 
 
 		 588 aa  526  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2392  peptidoglycan synthetase FtsI  48.46 
 
 		 572 aa  494  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00596115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0352  peptidoglycan synthetase FtsI  42.55 
 
 		 599 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  40.51 
 
 		 601 aa  428  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  40.11 
 
 		 580 aa  421  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2650  peptidoglycan synthetase FtsI precursor (peptidoglycan glycosyltransferase 3) (penicillin-binding protein 3)  41.97 
 
 		 579 aa  412  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  38.52 
 
 		 597 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  39.86 
 
 		 586 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  39.96 
 
 		 578 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  41.34 
 
 		 610 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  39.43 
 
 		 578 aa  403  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  39.61 
 
 		 583 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  39.25 
 
 		 578 aa  398  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  39.08 
 
 		 578 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  39.08 
 
 		 583 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  39.08 
 
 		 583 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  39.08 
 
 		 583 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  38.9 
 
 		 584 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.9 
 
 		 584 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  38.9 
 
 		 584 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  38.9 
 
 		 584 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3810  peptidoglycan glycosyltransferase  40.11 
 
 		 582 aa  391  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  37.83 
 
 		 578 aa  391  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  38.54 
 
 		 583 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  37.89 
 
 		 581 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4471  peptidoglycan synthetase FtsI  37.57 
 
 		 591 aa  362  1e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  37.24 
 
 		 585 aa  362  1e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  37.35 
 
 		 578 aa  360  4e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  36.45 
 
 		 579 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  36.27 
 
 		 579 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.8 
 
 		 570 aa  348  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  37.12 
 
 		 575 aa  346  6e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  36.43 
 
 		 579 aa  342  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  36.14 
 
 		 583 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  36.31 
 
 		 578 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.55 
 
 		 582 aa  337  3.9999999999999995e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  35.12 
 
 		 587 aa  336  5.999999999999999e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  35.64 
 
 		 613 aa  336  7.999999999999999e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  35.62 
 
 		 570 aa  335  9e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  34.64 
 
 		 618 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  34.91 
 
 		 575 aa  335  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  36.15 
 
 		 575 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  35.54 
 
 		 630 aa  335  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  36.36 
 
 		 583 aa  334  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  36.1 
 
 		 621 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  34.61 
 
 		 580 aa  334  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  33.82 
 
 		 582 aa  333  5e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.94 
 
 		 619 aa  332  9e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  35.18 
 
 		 630 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  35.29 
 
 		 613 aa  332  1e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  36.23 
 
 		 616 aa  332  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  35.94 
 
 		 624 aa  332  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.92 
 
 		 621 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  35.4 
 
 		 553 aa  330  4e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  35.87 
 
 		 615 aa  329  7e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  36.05 
 
 		 615 aa  329  9e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  36.05 
 
 		 615 aa  329  9e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  36.05 
 
 		 615 aa  329  9e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  33.82 
 
 		 581 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  36.05 
 
 		 615 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  35.22 
 
 		 553 aa  328  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  33.81 
 
 		 632 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  35.56 
 
 		 582 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  33.81 
 
 		 632 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  33.81 
 
 		 632 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  35.87 
 
 		 615 aa  327  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  35.74 
 
 		 582 aa  327  5e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  36.1 
 
 		 622 aa  325  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  34.36 
 
 		 582 aa  325  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  34.36 
 
 		 578 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  34.11 
 
 		 568 aa  323  4e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>