More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0352 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0089  peptidoglycan synthetase FtsI  54.43 
 
 
588 aa  635    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679095  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0352  peptidoglycan synthetase FtsI  100 
 
 
599 aa  1217    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3786  Peptidoglycan glycosyltransferase  55.15 
 
 
587 aa  635    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0604  Peptidoglycan glycosyltransferase  56.44 
 
 
587 aa  635    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00085  transpeptidase involved in septal peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 3)  54.26 
 
 
588 aa  633  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3516  Peptidoglycan glycosyltransferase  54.26 
 
 
588 aa  633  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00084  hypothetical protein  54.26 
 
 
588 aa  633  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3598  Peptidoglycan glycosyltransferase  55.33 
 
 
587 aa  634  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0092  peptidoglycan synthetase FtsI  54.26 
 
 
588 aa  633  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.948544 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0077  peptidoglycan synthetase FtsI  54.26 
 
 
588 aa  633  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3573  peptidoglycan glycosyltransferase  54.26 
 
 
588 aa  633  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0086  peptidoglycan synthetase FtsI  54.26 
 
 
588 aa  633  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.67693  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0090  peptidoglycan synthetase FtsI  54.26 
 
 
588 aa  633  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0642  Peptidoglycan glycosyltransferase  56.44 
 
 
587 aa  626  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.407482  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0138  peptidoglycan synthetase FtsI  53.53 
 
 
588 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.154008 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0755  peptidoglycan glycosyltransferase  54.43 
 
 
587 aa  622  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0134  peptidoglycan synthetase FtsI  53.53 
 
 
588 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000490417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0139  peptidoglycan synthetase FtsI  53.53 
 
 
588 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0134  peptidoglycan synthetase FtsI  53.53 
 
 
588 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0131  peptidoglycan synthetase FtsI  53.53 
 
 
588 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3524  peptidoglycan glycosyltransferase  52.98 
 
 
587 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.568102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2924  penicillin-binding protein 3  52.8 
 
 
587 aa  616  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3393  penicillin-binding protein  52.98 
 
 
587 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0630  peptidoglycan synthetase FtsI  53.55 
 
 
588 aa  604  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1976  peptidoglycan synthetase FtsI  53.45 
 
 
581 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0049201  normal  0.138464 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1295  peptidoglycan synthetase FtsI  53.45 
 
 
581 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103537  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2037  peptidoglycan synthetase FtsI  53.45 
 
 
581 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00133127  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1980  peptidoglycan synthetase FtsI  53.45 
 
 
581 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0756202  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1479  peptidoglycan synthetase FtsI  53.27 
 
 
581 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0193532  normal  0.796051 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2392  peptidoglycan synthetase FtsI  51.09 
 
 
572 aa  553  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00596115  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  48.57 
 
 
597 aa  551  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  48.48 
 
 
601 aa  551  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  46.21 
 
 
580 aa  525  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  46.73 
 
 
583 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2650  peptidoglycan synthetase FtsI precursor (peptidoglycan glycosyltransferase 3) (penicillin-binding protein 3)  47 
 
 
579 aa  521  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  46.37 
 
 
583 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  46.37 
 
 
583 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  46.37 
 
 
583 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  47 
 
 
578 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  46.18 
 
 
584 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.18 
 
 
584 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  46.36 
 
 
584 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  45.74 
 
 
578 aa  513  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  46.18 
 
 
584 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  45.91 
 
 
578 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  46.37 
 
 
583 aa  509  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  45.73 
 
 
578 aa  511  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  46.75 
 
 
586 aa  511  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3810  peptidoglycan glycosyltransferase  45.81 
 
 
582 aa  510  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  45.34 
 
 
578 aa  504  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  44.36 
 
 
581 aa  500  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  44.33 
 
 
610 aa  482  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2357  peptidoglycan glycosyltransferase  43.96 
 
 
572 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  43.5 
 
 
585 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2124  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.55 
 
 
568 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.23462  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4471  peptidoglycan synthetase FtsI  42.48 
 
 
591 aa  442  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.49 
 
 
570 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  40.54 
 
 
579 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  41.74 
 
 
582 aa  410  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  42.78 
 
 
570 aa  411  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  41.49 
 
 
587 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  40.54 
 
 
579 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  41.92 
 
 
570 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  38.29 
 
 
577 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  40.18 
 
 
616 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  40.36 
 
 
615 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  39.67 
 
 
613 aa  395  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  40.36 
 
 
615 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  41.62 
 
 
578 aa  398  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  40.47 
 
 
624 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  40.36 
 
 
615 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  40 
 
 
615 aa  395  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  39.82 
 
 
615 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  40 
 
 
578 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  39.49 
 
 
613 aa  394  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  40.11 
 
 
621 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  38.03 
 
 
614 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  40.26 
 
 
607 aa  393  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  40 
 
 
615 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  39 
 
 
583 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  41.13 
 
 
575 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  38.07 
 
 
581 aa  388  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.38 
 
 
621 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  39.5 
 
 
622 aa  386  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  38.11 
 
 
580 aa  388  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  39.57 
 
 
582 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  40.4 
 
 
553 aa  383  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  40.59 
 
 
553 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2968  penicillin-binding protein 3A  41.35 
 
 
565 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  39.86 
 
 
583 aa  383  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  38.13 
 
 
578 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  38.81 
 
 
614 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35190  penicillin-binding protein 3A  40.98 
 
 
565 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  38.88 
 
 
580 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  38.64 
 
 
614 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  38.64 
 
 
614 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  38.84 
 
 
614 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  38.39 
 
 
568 aa  381  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  38.64 
 
 
614 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  38.64 
 
 
614 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>