More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1401 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  71.08 
 
 
583 aa  830    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
727 aa  1432    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.76 
 
 
702 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  52.52 
 
 
638 aa  569  1e-161  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.29 
 
 
655 aa  519  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  49.28 
 
 
653 aa  510  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  47.31 
 
 
670 aa  483  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  44.24 
 
 
839 aa  469  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3205  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.71 
 
 
635 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0996816  normal  0.0272319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1656  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.08 
 
 
682 aa  445  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22860  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.3 
 
 
754 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.81 
 
 
607 aa  411  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16620  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  41.4 
 
 
663 aa  400  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.422305  normal  0.0185219 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1278  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.89 
 
 
618 aa  391  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.907115  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3069  peptidoglycan glycosyltransferase  40.31 
 
 
586 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0109625  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.85 
 
 
692 aa  383  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.69 
 
 
581 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1068  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.75 
 
 
579 aa  382  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2665  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.24 
 
 
677 aa  375  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.58 
 
 
635 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1565  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.84 
 
 
600 aa  369  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3218  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.68 
 
 
716 aa  364  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0525983 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3023  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.21 
 
 
634 aa  364  4e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0205906  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3444  peptidoglycan glycosyltransferase  35.87 
 
 
716 aa  363  9e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00730132  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.37 
 
 
657 aa  359  8e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  38.22 
 
 
635 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3529  peptidoglycan glycosyltransferase  38.29 
 
 
652 aa  356  6.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0960605  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12193  penicillin-binding membrane protein pbpB  37.16 
 
 
679 aa  352  2e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.98253e-20  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  37.48 
 
 
657 aa  351  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3273  peptidoglycan glycosyltransferase  37.8 
 
 
642 aa  347  5e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709571  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3262  peptidoglycan glycosyltransferase  37.8 
 
 
642 aa  347  5e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258403  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1564  peptidoglycan glycosyltransferase  36.92 
 
 
600 aa  347  5e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.924242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3324  peptidoglycan glycosyltransferase  37.8 
 
 
642 aa  347  5e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0881195  normal  0.041689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24950  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.8 
 
 
637 aa  346  1e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439069  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.16 
 
 
654 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2652  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.75 
 
 
654 aa  338  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  38.58 
 
 
656 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  37.7 
 
 
657 aa  337  5.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  39.42 
 
 
708 aa  330  6e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.66 
 
 
662 aa  329  9e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  38 
 
 
552 aa  329  1.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  37.68 
 
 
577 aa  327  5e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  38.04 
 
 
548 aa  326  1e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  36.51 
 
 
660 aa  325  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.64 
 
 
553 aa  321  3e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  38.53 
 
 
657 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.16 
 
 
570 aa  320  6e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.44 
 
 
672 aa  319  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3930  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.05 
 
 
570 aa  318  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000459011  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2416  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.9 
 
 
584 aa  318  2e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  36.23 
 
 
695 aa  318  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  36.82 
 
 
582 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  37.87 
 
 
622 aa  316  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  37.02 
 
 
711 aa  313  5.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1498  peptidoglycan glycosyltransferase  38.49 
 
 
556 aa  313  6.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00439152  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.72 
 
 
594 aa  312  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  37.72 
 
 
594 aa  312  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  37.68 
 
 
613 aa  311  2.9999999999999997e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2100  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.25 
 
 
568 aa  310  9e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000215244 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  35.23 
 
 
705 aa  310  9e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  37.5 
 
 
613 aa  309  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.78 
 
 
703 aa  309  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  36.13 
 
 
586 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.58 
 
 
582 aa  303  7.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.53 
 
 
614 aa  303  7.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  36.04 
 
 
580 aa  300  8e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  34.32 
 
 
577 aa  300  9e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  34.22 
 
 
579 aa  300  9e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  35.01 
 
 
575 aa  299  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13660  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.69 
 
 
608 aa  298  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00924315  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  35.78 
 
 
587 aa  298  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  33.51 
 
 
719 aa  295  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  35.61 
 
 
723 aa  295  3e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.63 
 
 
582 aa  293  7e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.51 
 
 
654 aa  293  9e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  32.18 
 
 
576 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  35.16 
 
 
583 aa  292  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  33.7 
 
 
579 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  34.45 
 
 
582 aa  291  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  33.7 
 
 
579 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  32.27 
 
 
578 aa  291  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  33.57 
 
 
713 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  34.34 
 
 
570 aa  290  6e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  32.3 
 
 
580 aa  289  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  32.54 
 
 
575 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  33.81 
 
 
586 aa  288  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  33.86 
 
 
582 aa  288  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  34.53 
 
 
553 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  34.1 
 
 
581 aa  288  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  33.74 
 
 
607 aa  286  7e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  34.9 
 
 
614 aa  286  9e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.09 
 
 
582 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  34.74 
 
 
578 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2515  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.88 
 
 
584 aa  284  5.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.678179  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.89 
 
 
571 aa  284  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0089  peptidoglycan synthetase FtsI  35.71 
 
 
588 aa  284  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679095  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2895  peptidoglycan synthetase FtsI , putative  34.88 
 
 
584 aa  284  5.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0090  peptidoglycan synthetase FtsI  35.71 
 
 
588 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.7 
 
 
689 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  33.57 
 
 
578 aa  283  6.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>