More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0735 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  53.15 
 
 
710 aa  726    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  62.93 
 
 
654 aa  841    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  52.21 
 
 
675 aa  681    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
690 aa  1405    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.5 
 
 
644 aa  559  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.96 
 
 
645 aa  532  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  40.03 
 
 
657 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  39.81 
 
 
657 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  38.71 
 
 
657 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.48 
 
 
654 aa  436  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  40.77 
 
 
656 aa  433  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.39 
 
 
662 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  39.23 
 
 
660 aa  425  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  39.88 
 
 
657 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  37.57 
 
 
586 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.64 
 
 
703 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  37.1 
 
 
729 aa  333  8e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.96 
 
 
708 aa  330  7e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  33.08 
 
 
695 aa  319  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  36.48 
 
 
607 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  34.83 
 
 
582 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  33.74 
 
 
708 aa  313  4.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  34.82 
 
 
577 aa  310  6.999999999999999e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  36.22 
 
 
653 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  35.34 
 
 
671 aa  302  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  34.28 
 
 
582 aa  301  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.94 
 
 
570 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  32.97 
 
 
705 aa  300  6e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.1 
 
 
582 aa  299  9e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  33.04 
 
 
581 aa  298  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  32.12 
 
 
713 aa  298  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  32.74 
 
 
578 aa  297  5e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  32.55 
 
 
614 aa  296  6e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  33.63 
 
 
631 aa  297  6e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  33.63 
 
 
578 aa  296  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.81 
 
 
583 aa  294  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  33.52 
 
 
580 aa  294  4e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  32.62 
 
 
577 aa  293  7e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.16 
 
 
582 aa  291  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  32.32 
 
 
740 aa  290  5.0000000000000004e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  33.1 
 
 
578 aa  289  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.57 
 
 
670 aa  289  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  34.3 
 
 
618 aa  289  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  34.16 
 
 
578 aa  288  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  32.87 
 
 
578 aa  289  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  32.71 
 
 
578 aa  288  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  32.92 
 
 
580 aa  288  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  34.62 
 
 
552 aa  287  4e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  34.22 
 
 
613 aa  287  4e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.05 
 
 
590 aa  287  4e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  34.22 
 
 
613 aa  287  4e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  35.66 
 
 
590 aa  287  4e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  34.62 
 
 
548 aa  287  5e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.92 
 
 
582 aa  287  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.09 
 
 
588 aa  286  7e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  32.93 
 
 
580 aa  286  7e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  34.57 
 
 
622 aa  286  9e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.2 
 
 
680 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  32.84 
 
 
585 aa  286  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  31.84 
 
 
711 aa  285  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  32.45 
 
 
582 aa  285  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  34.46 
 
 
632 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  34.46 
 
 
632 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.22 
 
 
655 aa  284  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  34.46 
 
 
632 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3765  peptidoglycan glycosyltransferase  35.58 
 
 
675 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870412  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  32.05 
 
 
586 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.05 
 
 
675 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  34.94 
 
 
670 aa  282  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0352  peptidoglycan synthetase FtsI  32.69 
 
 
599 aa  283  1e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  35.57 
 
 
595 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  33.82 
 
 
597 aa  282  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  33.86 
 
 
594 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  33.86 
 
 
594 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  33.86 
 
 
594 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  32.79 
 
 
553 aa  281  3e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  32.14 
 
 
570 aa  281  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  33.86 
 
 
594 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  33.86 
 
 
594 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3905  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.11 
 
 
675 aa  281  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  33.68 
 
 
594 aa  281  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  34.88 
 
 
638 aa  281  4e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  33.56 
 
 
631 aa  280  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  33.68 
 
 
594 aa  280  7e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  32.43 
 
 
553 aa  280  7e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  32.31 
 
 
584 aa  280  8e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  32.31 
 
 
584 aa  280  8e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.31 
 
 
584 aa  280  8e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  36.53 
 
 
587 aa  280  9e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  32.14 
 
 
584 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  34.33 
 
 
727 aa  279  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  32.65 
 
 
583 aa  279  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  33.1 
 
 
614 aa  279  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  31.39 
 
 
719 aa  279  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  33.1 
 
 
614 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  33.51 
 
 
630 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  33.1 
 
 
614 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  33.1 
 
 
614 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  33.1 
 
 
614 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  33.51 
 
 
596 aa  278  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>