More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1107 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  54.68 
 
 
654 aa  710    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
710 aa  1460    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  53.15 
 
 
690 aa  726    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  48.73 
 
 
675 aa  632  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.31 
 
 
645 aa  531  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.06 
 
 
644 aa  526  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.66 
 
 
657 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.24 
 
 
662 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.05 
 
 
654 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  37.5 
 
 
660 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  37.9 
 
 
657 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  36.68 
 
 
657 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  37.73 
 
 
656 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  37.54 
 
 
657 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  37.52 
 
 
586 aa  358  2.9999999999999997e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.15 
 
 
703 aa  344  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  35.75 
 
 
729 aa  325  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
631 aa  317  5e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.84 
 
 
588 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
708 aa  313  9e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  34.3 
 
 
582 aa  312  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0352  peptidoglycan synthetase FtsI  35.54 
 
 
599 aa  312  2e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  34.17 
 
 
578 aa  311  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  33.88 
 
 
708 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  31.94 
 
 
695 aa  309  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.58 
 
 
570 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  35.47 
 
 
578 aa  308  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  33.21 
 
 
586 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  34.88 
 
 
578 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  34.34 
 
 
578 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  34.55 
 
 
607 aa  301  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  32.88 
 
 
580 aa  301  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  34.12 
 
 
582 aa  299  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.51 
 
 
582 aa  298  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  33.51 
 
 
582 aa  298  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  32.66 
 
 
597 aa  297  3e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  34.53 
 
 
581 aa  296  8e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  33.58 
 
 
577 aa  296  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  34.04 
 
 
578 aa  295  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  33.94 
 
 
580 aa  295  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  33.27 
 
 
583 aa  295  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  32.49 
 
 
601 aa  294  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  31.18 
 
 
719 aa  293  8e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  34.04 
 
 
577 aa  292  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  32.18 
 
 
579 aa  293  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  32.57 
 
 
713 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3905  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.83 
 
 
675 aa  291  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 
580 aa  291  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 
614 aa  290  7e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  32.78 
 
 
671 aa  290  7e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  33.57 
 
 
575 aa  290  8e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.03 
 
 
594 aa  290  8e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  33.03 
 
 
594 aa  290  8e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.67 
 
 
675 aa  289  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  32.54 
 
 
585 aa  289  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.16 
 
 
582 aa  289  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3765  peptidoglycan glycosyltransferase  34.52 
 
 
675 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870412  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  32.45 
 
 
587 aa  288  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.87 
 
 
582 aa  288  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  33.39 
 
 
548 aa  287  5e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  32.97 
 
 
570 aa  287  5e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  33.39 
 
 
552 aa  287  5e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  32.85 
 
 
578 aa  287  5.999999999999999e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  34.79 
 
 
578 aa  287  5.999999999999999e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  31.96 
 
 
705 aa  286  8e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
649 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  32.57 
 
 
615 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  33.33 
 
 
621 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
630 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.09 
 
 
689 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  33.15 
 
 
587 aa  285  3.0000000000000004e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  31.55 
 
 
584 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.55 
 
 
584 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  32.27 
 
 
615 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  31.55 
 
 
584 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  32.39 
 
 
615 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  32.57 
 
 
631 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35190  penicillin-binding protein 3A  34.31 
 
 
565 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  31.37 
 
 
584 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  32.39 
 
 
615 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 
630 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0131  peptidoglycan synthetase FtsI  33.33 
 
 
588 aa  283  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.7 
 
 
571 aa  282  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0138  peptidoglycan synthetase FtsI  33.33 
 
 
588 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.154008 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0139  peptidoglycan synthetase FtsI  33.33 
 
 
588 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  32.44 
 
 
618 aa  283  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0134  peptidoglycan synthetase FtsI  33.33 
 
 
588 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  32.92 
 
 
624 aa  283  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0134  peptidoglycan synthetase FtsI  33.33 
 
 
588 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000490417 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3598  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.64 
 
 
587 aa  282  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  33.82 
 
 
613 aa  281  4e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  32.08 
 
 
581 aa  281  4e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.15 
 
 
621 aa  281  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  36.31 
 
 
590 aa  281  4e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  31.69 
 
 
610 aa  281  4e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  31.92 
 
 
615 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  31.92 
 
 
615 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  33.82 
 
 
613 aa  280  6e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3786  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.21 
 
 
587 aa  280  7e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  33.09 
 
 
622 aa  280  7e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>